目前治疗乙肝主要是抗病毒治疗，可使用干扰素和核苷类似物。
两种药物各有优缺点。使用干扰素，既有抗病毒作用，也有免疫调节作用，且有一部分优选患者经过干扰素抗病毒治疗，疾病被治愈的几率较大，但这种比例较低，使用干扰素费用较贵，不良反应的发生率较高，会导致部分患者不耐受。使用核苷类似物，大部分患者都耐受，不良反应发生率也较低，但患者需要长期用药，部分患者需要终身用药。
因此，患者需根据自身情况，在专业医生的建议进行药物治疗。
乙肝的检查分为以下两个部分：
1、血清学标记物检查：乙肝两对半或者是乙肝七项；如果出现表面抗原、E抗原、E抗体、核心抗体等均为阳性，需要做乙肝DNA的检测，以了解病毒的复制和复制情况；如果DNA呈阳性，说明有感染，需要做肝功能、凝血功能、HBV基因分型等方面的检查；同时，乙型肝炎病人要定期做好甲胎球蛋白的检查，以防止肝癌的发生。
2、影像学：即时弹力成像是评价肝组织弹性的重要手段，间接评价肝纤维化、肝硬化的程度；同时进行腹部彩超，病情严重的可以进行CT、MRI等筛查，以明确早期的肝癌。
对于乙肝的治疗，现在多数是以口服抗病毒的药物为主，对于乙肝的传播主要是通过血液、母婴垂直传播、性接触等途径，并不是所有的乙肝都需要抗病毒治疗，对于乙肝病毒携带者，可以采取定期观察（肝功、病毒含量、超声、甲胎蛋白等）。
首先要是提高自身免疫能力和抗病毒能力。只有当DNA呈阴性时，病人的病情才能稳定下来。另一方面，应采取保护肝、保护肝的治疗，使肝功能正常，肝不受损。定期到医院进行系统检查，在专家指导下用药。此外，应该注意饮食，避免饮酒，避免辛辣食物，注意不要过度劳累和熬夜，保持好心情，加强锻炼，提高自我免疫力。
治乙肝必治肝，治肝即疏肝气、养肝阴、通肝络。盖乙肝病毒混于血、潜于肝，滞肝气、损肝阴、瘀肝络，故要疏肝气、养肝阴、通肝络，此三法在实际案中都有体现。治乙肝必解混血潜肝之毒，中药配方中使用叶下珠、垂盆草、半边莲等即是解肝毒之意。
肝功能，甲胎蛋白，血常规，肝脏彩超：必查项目；凝血时间：反映肝脏合成很重要的指标，CT或者磁共振：B超发现有异常时，病人检查CT或磁共振，乙肝病毒定量：决定是否需要抗病毒治疗，肝纤维化指标检查：决定是否使用抗纤维化的药物。