去除牙结石最有效的方法是牙周洁治，是通过超声振动将牙结石从牙齿上震下来。不过如果牙结石的位置较深的，洁治以后大约一周还需要刮治，是医生手动器械刮出龈下牙石，龈下牙石的危害要大于龈上牙石。所以去除牙结石要仔细检查，去除干净，而且需要专业手法，避免将牙结石推向牙龈深部引起牙周脓肿。
通常存在于唾液腺开口处的牙齿表面，下颚前牙的舌侧表面，上颚后牙的颊侧表面和牙齿的颈部，以及口腔、口腔黏膜运动不到的牙齿表面等处。牙结石开始是乳白色的软垢，会因逐渐的钙化而变硬。牙结石是牙周病发展的一个重要致病因素，不注意养成良好的口腔卫生习惯，即使彻底洁治后，牙结石很容易再次沉积在牙齿表面。
可以选择用洗牙的方式进行去除。常规的超声波震荡洗牙可以去除龈上的牙结石，而龈下的牙结石一般选择做龈下刮治，现在也有超声波震荡的龈下刮治的仪器，可以去除龈下的牙结石。
牙结石考虑是由于细菌或者菌斑钙化引起的，可以进行龈下刮治术，可以清除牙齿表面的牙结石、牙菌斑，可口含姜片、食醋进行灭菌治疗，多吃新鲜的蔬菜水果，或者进行洗牙或者超声波洁牙，配合口服消炎药物，也可使用双氧水，碳酸氢钠溶液进行局部冲洗。
最快速的方法就是洗牙，这是见效比较明显的，如果牙结石比较严重，可以进行超声刀技术。比较经济方便的是电动牙刷搭配比较有清洁力的牙膏，少喝咖啡浓茶等，空腔清洁是首要。
清理牙结石是没有危害的。牙结石是一种附着在牙齿表面上的矿化沉积物，非常坚硬，与牙齿紧密结合，患者自己没有办法去除。如果自己清理牙结石，比如用力抠掉或者磨掉，会对牙齿、牙龈组织造成损伤，甚至会导致牙齿松动、脱落或者感染。