口腔溃疡反复发作，多和个人的生活饮食习惯有关系，也和身体微量元素缺乏有关。所以治疗要从生活饮食习惯调理和补充微量元素入手。对于反复发作性口腔溃疡，建议补充葡萄糖酸锌、复合维生素B和维生素C治疗。生活中不要吃容易上火食物，口味选择清淡一点，不能挑食，多吃蔬菜水果，晚上十点之前睡觉，早晨6点之后起床，规律后一般可以明显减少口腔溃疡发病次数。
口腔溃疡治疗原则是消除致病诱因，增进机体健康，减轻局部症状，促进溃疡愈合，但是目前还没有特效药物，所以治疗时应针对每个病例的致病诱因和对药物的反应，有侧重地采用治疗方法和药物。平常注意休息，避免进食酸辣刺激食物，以减少复发次数。
口腔溃疡根据病因不同，治疗方案也不同。如果溃疡由创伤引发，可通过去除刺激因素，同时促进溃疡愈合进行治疗。如果是复发性阿弗他溃疡，治疗方案比较复杂。常见药物为免疫抑制剂或漱口水等，病人可口服或外用。需要注意，复发性阿弗他溃疡，服用抗生素治疗无效，所以病人要在医师指导下服用药物，切忌自行服药。
如果口腔粘膜的溃疡长时间不愈，应及时到正规医院或者医疗机构就医，行相关检查，以便明确诊断后对症治疗。平时应注意增强体质，减少感冒鼻塞等，补充足够的水分，清淡软食，少吃辛辣以及甜食，戒烟戒酒，按时作息。多吃蔬菜与水果。
现在有很多儿童都会出现口腔溃疡，是由于饮食不均衡造成的，很可能是由于平时吃过多的荤腥油腻食物却不怎么吃新鲜的瓜果蔬菜，所以平时一定要给孩子吃新鲜的瓜果蔬菜，如果口腔溃疡太过于严重的话，可以选择相关喷剂进行治疗。
