正畸治疗的流程，一般是要到正规医院的口腔科，或者是大型医院的口腔正畸科进行检查。先由医生进行口腔内的全面检查，进行诊断。看是哪一种类型的颌骨畸形或者是牙齿畸形，进行曲面断层片和头颅侧位片的检查。
检查需要拍X光片，拍摄面部牙合照片、取模型，用于医生对牙齿畸形进行分析、诊断和设计，以及留待日后与治疗结束时作对比。制定矫正计划，初戴矫治器，开始第一次在口腔粘固矫治器，即初戴牙套。
正畸牙齿的移动是根据生物力学原理，牙根长在牙槽骨里，正畸的力量使牙槽骨的受力则会出现骨吸收，受到牵引的一侧会出现骨增生，因此牙齿会在颌骨内产生移动，正畸就是利用这种生物力学原理。
牙齿拥挤正畸时牙齿本身是不会疼痛的，但是矫正时牙齿与齿槽骨之间的牙周膜受到拥挤会拉扯。当组织受力而变形后，血液流通受阻，形成缺氧的状态，这就导致了牙齿钝痛的出现，矫正牙齿后5到6个小时才会有轻微的痛觉，会持续三到四天。在刚戴上固定矫治器和每次复诊后3-6天内，会感觉有些疼痛，咀嚼无力，这几天可以吃比较软的食物。疼痛会逐渐减轻，直至消失。
不一定需要拔牙，每个人的情况不同，要根据个人的不同情况进行针对性治疗。如果牙齿只是不整齐，是不需要拔牙的，如果有多齿才需要拔牙，然后再进行牙齿矫正。否则会影响其他牙齿的矫正效果。