牙齿有黑色的牙垢主要是色素沉着。如果病人经常饮用咖啡、浓茶，或者是带黑色素的饮料，容易在牙齿的颈部或者牙面有色素沉着。或者是龈下牙石。龈下牙石呈灰黑色，位于牙龈缘的下方。需要进行牙周治疗，用超声洁治器可以去除牙齿表面的色素沉着，用刮治器可以去除龈下牙石，然后进行牙龈沟冲洗，局部上药，回家以后要好好刷牙。
牙上的牙垢可以用以下几种方法去除，食醋法，取食醋口含，在口腔鼓漱但不吐，口含二三分钟再吐出，再用牙刷刷洗，最后用温水漱口。红糖刷牙法，先取适量红糖放进口中，含15分钟左右，再用较硬实的牙刷反复刷二三分钟，每日早晚各1次，连续1周可除。可借助于牙粉。使用牙线，牙线是清除牙垢的好帮手。还可到正规的口腔医院进行超声波洁牙，是一种高效、卫生、方便、舒适的牙齿洁治手段。
刷牙以45度角，将牙刷置於牙齿与牙龈的交界处，轻轻的以圆形的方式移动牙刷，不要忽略臼齿部位，刷牙两分钟，不是三十秒匆匆的结束，在刷牙的时候，在牙刷上用点酵母粉可以帮助牙齿变白的，饮食尽量注意清淡易消化，少吃一些刺激性的食物。
牙垢通过洗牙可以洗干净，洗牙也就是进行洁治或者刮治，通过超声洁治器可以去除龈上牙石、软垢、牙面上的各种色素沉着，通过刮治器可以去除龈下牙石，所以通过洁治或者刮治可以去除牙面和牙颈部的牙垢。
通过超声洁治器去除牙颈部的软垢和牙石，然后局部冲洗，外用碘甘油。自己回家后要好好刷牙，采用中华口腔医学会巴氏刷牙法。每天三餐后加上睡觉前刷牙，至少要在早餐后加睡觉前刷牙。每次刷牙前要用牙线清理邻面牙颈部的食物残渣和软垢，然后再进行刷牙，每次刷牙不得少于3分钟。