舌根起泡极有可能是因为舌头轮廓乳头出现了肿胀，还有可能就是吃到太热的东西、太热的水，被烫伤导致口腔黏膜出现水泡。
舌表面皮肤温度较高，容易导致细菌滋生而引发炎症。如身体缺乏维生素或内分泌失调等，均可使舌头起泡。因此，患有舌泡疹患者一定要注意饮食和运动，避免过度疲劳，以免引发口疮。有必要去正规口腔科医院进行细致检查，可遵医嘱口服抗炎类药物治疗，为了避免局部疼痛感的增加。
舌头根部起泡有可能是因为天气干燥，过多地食用了辛辣刺激性的食物引起的上火，可见舌根起泡，可能是补充的水分不够，注意饮食没有多样化，没有多吃粗粮，生活不规律，经常熬夜造成的。舌头根部起泡也有可能是疱疹病毒感染引起的。
舌根起泡可能由舌炎、营养不良、维生素缺乏、内分泌紊乱、月经周期效应、贫血、血液疾病、真菌感染引起。其他是局部因素，如尖部锋利边缘、假体不良、不良习惯和其他外部刺激。
舌根疼痛的原因有很多种，常见的有急性咽喉炎、急性会厌炎、咽部异物等。一般受凉后出现的多为急性咽喉炎，急性咽喉炎，咽痛症状多为干痛、吞咽疼痛，没有呼吸不畅。而急性会厌炎症状重时，可有呼吸困难，发热、大汗淋漓等症状，需要特别注意。而有时咽部异物时也会引起舌根部疼痛。
考虑是舌下腺体囊肿导致的不适少吃辣椒煎炸食物，到黏膜科就诊后如果是囊肿早日手术摘除。口腔炎症刺激造成的，或者缺乏维生素导致的，可以补充维生素，注意口腔卫生。