可以通过药物、手术等方式治疗甲亢突眼症。
对于突眼的药物治疗，可以选择强的松等皮质激素，但作用缓慢，病程长，副作用也多。还有一些其它的免疫抑制剂，比如环磷酰氨，也可以起到一定的效果，不过副作用会比较大。除此之外，云克治疗也可以用来改善突眼的症状，但是效果并不是很好。对严重的突眼症可以通过外科手术来进行治疗，但其效果并不明确。对于突眼症较严重的患者，可以采取其它的治疗措施，以减轻眼窝内的压迫，并配合换血疗法。
中医治疗甲亢病通常是采用理气舒郁、化痰消炎等方法。
甲亢在中医学中属于“瘿症”的范畴。中医上一般分为肝郁气滞、肝郁化火、气滞痰凝、气阴两虚等类型。因此，需要进行辨证治疗。中医治疗甲亢讲究的是理气舒郁，化痰消炎，痰结血瘀的治疗以理气活血、化痰消炎为主，而肝火旺盛型则以清肝泻火为主，而心肝阴虚型则以滋阴养精，宁心柔肝为主。
用中医治疗甲亢可以通过药物治疗来改善。
中医理论上说，甲状腺功能亢进与肝郁气滞、气郁化火有关系，肝郁气滞、气郁化火，这就是因为肝郁气滞、气郁化火，火旺会消耗气阴，造成阴虚火旺、气阴两虚之证，并伴有血瘀痰浊。在甲亢前期，主要表现为痰气交阻、瘀而化火，临床上可用消肿散、平亢等药物配合使用。在中期，主要表现在痰、血、瘀、消痈散、血府逐瘀汤等方面。在治疗的过程中，如果患者的身体状况会有气阴两虚、肝血不足等情况，可以选择益气养阴、补虚。如果是桥本氏症，那么可以通过白芍、藤类药等药物来进行调理，因为病人自身的抗体比较高。
昆布海藻饮：昆布、海藻、牡蛎用水煎汁。每日1次，连服数日，能疏肝清热，理气解郁。2、青柿子羹：蜂蜜适量。青柿子去柄洗净，捣烂并绞成汁，放锅中煎煮浓缩至粘稠，再加入蜂蜜1倍，继续煎至黏稠时，离火冷却、装瓶备用。每日2次，每次1汤匙，以沸水冲服，连服10天-15天。
抗甲状腺药物，放射碘治疗和手术治疗，甲状腺功能亢进症是甲状腺功能亢进和血液循环中甲状腺激素水平增高所致的一组常见的内分泌病，心悸，出汗，进食和大便次数增多以及体重减少等。