包括注射部位皮肤感染，或全身感染，因为糖皮质激素可能都会导致深部的感染和关节软组织的感染，因为可能会导致感染恶化，同样由于存在感染的风险，手术前三个月内，不能在需要更换的关节内局部注射糖皮质激素，抗凝治疗不是局部注射糖皮质激素的禁忌症。
糖皮质激素的相对禁忌症有，严重的精神病（包括现在和既往病史），癫痫，活动性消化性溃疡，新近胃肠吻合术，骨折，创伤修复期，角膜溃疡，肾上腺皮质功能亢进症，严重的高血压病，难以控制的糖尿病，抗菌药物不能控制的感染，如水痘，麻疹，真菌感染及孕妇等。
糖皮质激素失眠可以用中药进行调理。
糖皮质激素使用较多的西药种类，其副作用也比较常见。其中常见的副作用之一是失眠、烦躁和情绪激动。遇到这种情况，可以用黄疸、肉桂分别打开10克水泡服，服用后这些副作用基本上可以消失。因此，对这种激素敏感的患者每次用药都会先服用这一方，晚上不会失眠。对于长期服用激素引起的失眠，用15克黄疸、12克肉桂水煎煮，效果良好。
糖皮质激素是一种升血糖激素。胰岛素是人体内唯一的降血糖激素。但升血糖激素种类繁多，糖皮质激素是重要的升血糖激素之一。糖皮质激素可促进糖异生过程和糖原分解，从而拮抗胰岛素的作用，使血糖升高。
非糖尿病患者由于各种原因长期服用糖皮质激素时，会引起糖代谢异常，甚至糖尿病。长期服用糖皮质激素引起的糖尿病称为类固醇糖尿病。此外，糖皮质激素还可使糖尿病患者血糖升高，导致糖尿病患者血糖控制不佳。
糖皮质激素就是肾上腺皮质激素的一种，主要为皮质醇。也可以由化学方式人工合成。糖皮质激素具有调节糖、脂肪和蛋白质生物合成和代谢的作用，还具有抗炎、抑制免疫应答、抗毒、抗过敏、刺激骨髓造血、促进胃酸和胃蛋白酶的分泌等的作用。
糖皮质激素是一种很强的非特异性消炎药，在急性痛风性关节炎初期使用，可减轻关节腔内渗出、水肿、充血、白细胞吞噬反应等，可迅速减轻关节的红肿热痛等症状，还可减少局部黏连和结缔组织形成，但不良反应大，故在痛风性急性关节炎发作，首先使用秋水仙碱或非甾体抗炎药。