母亲甲减会导致宝宝智力下降，增加孩子出生缺陷几率。母亲甲减会增加婴儿患病的风险，其大多数是智力和发育上的问题，患有甲状腺疾病的母亲生下的婴儿发生出生缺陷的比例约为18%。而在普通人群中，有出生缺陷的婴儿仅约为3%。因此，对于患“甲减”等甲状腺疾病的女性，其胎儿在早期做好心脏缺陷等出生缺陷方面的检查。建议在孕期做好产检，如果筛查到甲减及时治疗，饮食以多维生素、高蛋白、高热量为主，可以降低影响。
甲减可以造成胎儿甲状腺激素的减少，特别是对胎儿和新生儿脑的发育尤为重要。严重的甲状腺激素缺乏会造成胎儿的大脑发育障碍，婴儿出生后生长缓慢，称为呆小症。
甲状腺激素影响胎儿脑发育，这是很明确的。在妊娠的前半期，胎儿大脑处于快速发育期，大脑的主要部分和脑干大部分的神经发生都在此阶段完成。胎儿的甲状腺功能在妊娠第12周开始建立，所以在前半期胎儿大脑发育所需要的甲状腺激素主要来自母体。如果在这个阶段，母亲的甲状腺激素缺乏，可以导致后代不可逆的智力下降。
建议孕妇对甲减应该特别重视，早发现、早治疗。妊娠期甲减治疗的原则是指早期启动，尽快达标。
甲减会影响妇科手术，如果是甲状腺功能减退症患者，甲状腺功能不能控制在正常范围内，贸然手术可能会导致粘液性水肿，甚至危及生命。所以如果要做手术治疗，首先要做甲状腺功能检查，明确甲状腺功能状态，如果患者处于甲状腺功能亢进症或甲状腺功能减退症时期，不能完成手术，需要服用药物，将甲状腺功能控制在正常范围后再进行手术治疗。
孕妇亚临床的甲减对胎儿也是会造成不良的影响的，主要是对胎儿的身高和智力造成影响。
，甲状腺激素是机体正常运转所必需的，十二周内的胎儿发育所需的甲状腺激素完全来自母体，之后胎儿虽开始自己合成甲状腺激素，但仍需依赖母亲保证激素水平充足。孕妇若患有甲减甲亢，会影响胎儿智力发育，甚至造成严重智力障碍甚至引发呆小症。
建议：在孕期检查出来，有亚临床甲减症状，还是应积极的进行有针对性的治疗和调理，应该遵循医师给出的建议调理治疗，并在日常生活中以及饮食等各方面要格外注意。
当准妈妈患有甲减时，胎儿就会和妈妈来争夺甲状腺激素，一旦胎儿脑发育所需要的甲状腺激素得不到正常供应的话，胎儿脑发育就会出现异常，影响智力和生长发育障碍。而且甲减也会增加胎儿早产、死产及胎盘早剥的危险。即使顺利度过孕期，准妈妈也将面临较高患上产后甲状腺炎的风险。
孕妇甲减可以导致胎儿甲状腺发育缺陷，也可造成胎儿死亡，最主要的是造成胎儿甲状腺激素减少。甲状腺激素是维持机体正常生长发育不可缺少的激素，胎儿的甲状腺功能在妊娠第12周开始建立，妊娠前半期胎儿大脑发育所需要的甲状腺激素完全或主要来自母体，孕妇的甲状腺素特别是对胎儿的脑的发育尤为重要。