治疗亚临床甲减没有什么特效的疗法。不要盲目用药，治疗的药物有多种，但都有一定的适应症，不一定都适合每个人，用药不对症，产生了抗药性、耐药性，致使延误病情，错失最佳的治疗时机。
亚临床甲减是没有明显的临床症状，例如典型的甲低表现，眼睛肿、皮肤干燥、大便干燥、记忆力差，但是可能会有生化检查的异常。例如血脂高、TSH高，而没有特别明显的临床上的表现，即亚临床甲减。所有临床上只要前面加一个亚字，就是临床症状不典型。
一般来说，亚临床甲减可以怀孕，具体分析如下：
临床甲减，如果病情得到了良好的治疗，治愈后是可以怀孕，但是如果病情没有稳定，尽量不要怀孕，可能会对孩子的智力发育会有一定的影响的。
应该注意休息，早睡早起，不要进行重体力劳动，避免剧烈运动，同时保持愉悦的心情，以清淡、易消化的饮食为主，保持良好的饮食习惯和睡眠习惯，少吃零食、速食，有利于身体的恢复。
一般情况下，亚临床甲减能否自愈需根据实际情况来判断，具体内容如下：
亚临床甲减会不会自行痊愈取决于具体的原因。如果是由于甲亢服用过多而引起的亚甲减，一般在三到四个星期内就会痊愈。如果是由于自身免疫所引起的亚甲基化，例如桥本甲状腺炎所引起的亚甲基化，其自身恢复能力极低。当体内的抗体增加时，对机体的损害就会增加，从而导致病情恶化，如果有了临床上的甲减，则要终生口服左甲状腺素片。
亚临床甲减一般是不能治疗的。因为引起亚临床甲减的主要原因是由于淋巴细胞甲状腺炎或者是甲亢病人行碘131治疗之后引起的，对于甲状腺的损害是不可逆的，是永久性的。但是对于亚临床甲减，可以通过药物进行控制。
亚临床甲减引起先天因素：甲状腺发育异常、甲状腺激素合成障碍等；后天因素：桥本甲状腺炎、抗甲状腺药物的治疗、亚急性甲状腺炎等；医源性甲状腺炎：甲亢经抗甲状腺药物治疗、甲状腺切除术后、甲状腺放射碘治疗后等，医源性因素是亚临床甲减第二类常见原因。