疱疹性咽峡炎与手足口病是有一定的区别，主要的原因区别就是，致病的病毒并不是同一种，疱疹性咽峡炎只是累及口腔黏膜，但是手足口病可以累及到手部以及足部，但是都是由于病毒感染导致的，治疗原则基本差不多。虽然疱疹性咽峡炎和手足口病有很大的区别，而且两者的症状严重程度也不是特别相同，但是都是要采取应用抗病毒的药物进行治疗。
一般情况下，疱疹性咽峡炎与手足口病区别主要有症状不同、发病部位不同等。
1.疱疹性咽峡炎：主要是由上呼吸道的急性炎症引起的，也可以是单个的，突然的高烧可以达到40度，伴有咽痛、食欲差、不吃东西等症状，在悬雍垂、软腭、咽腭弓区都会出现几个或几十个灰色的小疱疹。另外，也可能是在口腔的其它地方，疱疹破溃就会形成溃疡。
2.手足口病：症状为低热、咽痛、食欲差、口唇上有散在的疱疹和溃疡，手足、手臂、腿、臀部等部位会有皮疹，个别儿童会有严重的全身症状。
疱疹性咽颊炎，手足口病，这属于是病毒感染导致的，出现的时候，需要及时的采取抗病毒的治疗方式，可以吃利巴韦林，在这期间还应该注意监测体温，因为病毒性感染会容易导致发烧的现象，如果体温超过38.5度的时候应该及时的用退烧的药物治疗，如果体温没有超过38.5度之前可以采取物理降温，用温水擦或者洗温水澡。
疱疹性咽峡炎是一种常见的感染性疾病，一旦确诊，就需要按照以下程序处置：
1.勤洗手，注意饮食卫生。
2.加强患儿的护理，保持适宜的室内温度和湿度。
3.给患儿多喝水，降低患儿的体温，避免体温过高引起惊厥。
4.除了口腔局部用药外，还应给患儿口服抗病毒的药物，可选择小儿豉翘清热颗粒、连花清瘟颗粒等，促进患儿的好转。
通常情况下，小儿疱疹性咽峡炎吃半流或者流质食物、维生素丰富的食物比较好。具体分析如下：
疱疹性咽峡炎是由肠道病毒引起的以急性发热和咽峡部疱疹溃疡为特征的急性传染性咽颊炎，以粪-口或呼吸道为主要传播途径。小儿疱疹性咽峡炎建议给予清淡饮食，予以半流或者流质食物，如白粥、面条、馄饨、藕粉等，有利于病情恢复，还应进食蔬菜等维生素丰富的食物，比如胡萝卜、菠菜、芹菜等。
一般情况下，宝宝疱疹性咽峡炎需要通过多个方面进行护理。
宝宝疱疹性咽峡炎需要通过注意休息、室内多通风、多给宝宝饮水，宝宝应养成勤洗手的习惯，少到公共场所，不要随意使用抗生素。当宝宝出现不适症状时，家长应及时带儿童到正规医院进行确诊及治疗，同时要注意吃清淡比较容易消化的食物，多吃蔬菜、水果，应少量多次进食容易消化的流质、半流质食物，如米粥、面汤、果汁、菜汁等。