半夜两点多咳嗽是肺部在凌晨排毒，是气管炎感染、粘液分泌增多，缺乏负离子使气管粘膜上皮绒毛内呼吸酶的活性降低，影响肺泡的分泌和肺的通气和换气，导致的咳嗽。
咳嗽变异性哮喘、左心衰、上呼吸道感染等都是导致夜间咳嗽的因素。
1.左心衰：患者的运动能力和心功能下降，造成肺组织淤血，从而影响到肺的通气换气。平躺会导致肺淤血加重，咳嗽加重。
2.咳嗽变态哮喘：以干咳为主，夜间干咳症状加重。
3.上呼吸道感染：上呼吸道的炎症导致咽部粘膜组织的水肿。
需要在医生的指导下进行相应的检查和规范的治疗。
小儿夜间咳嗽可见于呼吸系统疾病和消化系统疾病，可见于支气管炎，咽喉炎，支气管肺炎，反流性食管炎等疾病有关。可能与炎症感染，反流的胃内容物刺激咽后壁，异物或刺激性气体吸入，气候改变等因素所致。
咳嗽主要见于呼吸、心血管系统和胸膜疾病。长期咳嗽多见于慢性支气管炎、咽喉炎、咳嗽变异性哮喘、肺结核等，如咳嗽有无激发因素，咳嗽有无伴见咳痰，痰色质等，由于咽痛，有无低热、盗汗、乏力等表现。
宝宝夜间如果频繁或者剧烈咳嗽，刺激咽喉部，可以出现咳嗽后呕吐，需要让宝宝变换体位，防止引起吸入性肺炎。咳嗽后呕吐一般是由感染因素引起，比如细菌、病毒、肺炎支原体等。最关键的治疗是控制感染，才能治疗咳嗽症状，必要时需要去医院验血常规c反蛋白等检查，明确感染的类型，对症治疗。
最常见的原因是呼吸道感染的情况。如果夜间咳嗽比较频繁，白天比较少，在秋冬季节比较容易出现类似的表现，需要考虑是由于气道的高反应状态导致的过敏性咳嗽。如果是咳嗽之后出现的呕吐，需要考虑是由于夜间咳嗽比较频繁而引起咽部的反射，出现干呕、呕吐。但是如果是呕吐之后出现的咳嗽，需要考虑是由于呕吐物刺激咽喉部而出现的咳嗽症状，所以还需要具体分析咳嗽和呕吐的伴随关系。