阿莫西林是广谱消炎药，对呼吸道感染、胃肠道感染、泌尿系感染、牙龈炎、牙周炎、中耳炎、毛囊炎等炎症均有效，但是，对支原体感染则没有效果。而阿奇霉素也是广谱消炎药，对支原体感染则有显著的效果，但是对胃肠道感染则没有效果，并且胃肠道感染患者吃阿奇霉素还会导致病情加重，因为阿奇霉素本身是红霉素类消炎药，红霉素类消炎药本身就会导致伪膜性肠炎而出现腹泻症状。
阿莫西林属于青霉素类的消炎药物，阿奇霉素属于第二代大环内酯类消炎药物。两者之间进行比较的话都属于是广谱抗菌药，阿莫西林针对革兰氏阳性菌革兰氏阴性菌，都有很好的抗菌效果。
阿奇霉素与阿莫西林两者抗菌谱不同，阿莫西林属于青霉素类药物，过敏患者是不能用的，治疗革兰氏阳性菌的药物对上呼吸道感染效果不错。阿奇霉素属于大环内酯类药物，阿奇霉素除了治疗阳性菌外治疗支原体和衣原体感染的效果比较的好。
这两种都属于抗生素，是不同类型的抗生素，如果在血象支持的前提下可以联合用药，但是如果只是一般的感冒引发咳嗽等，不可以联合应用，因为疾病都是有一个过程的，即使患者增加抗生素的用量，也不一定能很快的好转，反倒会增加药物的耐药性，对身体的副作用也更大。患者可以在医生指导下合理应用抗生素，可以选择一样口服。
前者和后者同根同源。前者属于一种半合成的青霉素制剂，胃肠道吸收比较完全，口服制剂当中比较常用。后者涵盖了很多种青霉素的制剂，包括口服、注射等等。如青霉素过敏或属于过敏体质，这两种都不可使用。
可以，阿奇霉素在结构当中属于大环内酯类抗菌药物，属于第2代的新品种。它的作用特点就是抑制细菌的蛋白质的合成。阿莫西林属于青霉素类的抗生素，副作用还是比较常见的。
