由于肛管处感染、外伤或刺激所致病变，如慢性肠道炎症的刺激、习惯性便秘者大便在直肠内积存时间过久或是大便干燥硬结。排便过程中造成损伤而继发细菌感染等。肛乳头肥大病人大多合并肛隐窝炎。由于部分肛管直肠外胚层及皮下组织的增生可导致肛乳头瘤在数目、形态及大小存在个体差异。
症状一是排便不尽感二是肛门瘙痒三是嵌顿四是肛门不适五是出血和疼痛，如果是有肛门乳头瘤癌变的话，它主要是由于有一个微生物直接堵在肛门口，从而导致大便难以解除建议，极好的方式是能够通过手术的方式来进行治疗，自己平时饮食方面也要注意清淡一些。
肛乳头瘤严重的症状表现为不断增长，越长越大，当大到一定程度时，就会随着大便的排出而脱出，有些会随着大便结束肛管上移后自动缩回，但如果体积过大，可能就无法收回，只能在擦大便时用手指将其送回，尤其是长有蒂的肛乳头瘤，蒂比较长，就更容易脱出，所以肛乳头瘤最为主要的症状就是脱出。
肛门不适，初起，肛门有坠胀的感觉，有时肛门瘙痒不适，如有炎症，不仅坠胀感明显，还可因刺激而频欲排便，肛乳头脱出，肛乳头长到一定程度，大便时能脱出肛外。开始大便后能自行回缩于肛内，逐渐需用手推方能缩回肛内，甚至长期脱出肛外。
肛乳头瘤的症状表现为肛门不适，有时自肛门脱出，多伴有肛门坠胀感，局部多无压痛。如果脱出纤维瘤时间较长，不能还纳，嵌顿于肛门口，可以局部可以形成炎症，导致疼痛难受。
典型症状有肛乳头瘤脱出、便后出血，排便不净、肛门瘙痒等，常见症状有：排便不尽感，在排便后还是有排泄物留在肛门内，有下坠的感觉，这就是排便不尽感。肛门瘙痒，乳头瘤随排便反复脱出肛门外，肛门受到摩擦导致炎症的发生，引起肛内分泌物流出，刺激肛周皮肤，引起瘙痒；嵌顿，肛乳头体积变大，脱出肛门外后，不能及时被推回到肛内就很容易引起嵌顿现象。