细针穿刺和粗针穿刺最主要的区别是使用器械是不一样的。细针穿刺使用的是普通的注射器，针头的口径就是临床上用的注射器的针头，对组织的刺激比较小。粗针穿刺是使用的特制的针头，粗针的口径可能会比较粗，通常来讲对组织的刺激性要比较大。
甲状腺粗针穿刺有风险，患甲状腺疾病后，一般采用细针抽吸，其给组织带来的风险很小。
因为甲状腺有疾病时，用粗针抽吸，可能局部感染，也可能引起血肿的形成。所以，出现这种情况，最好选择细针穿刺。这样，可以防止一些不良的症状。此外，在患有甲状腺疾病后，除疾病对症治疗外，患者还应采取调节措施，避免含碘量高的饮食以及不要饮酒。
绒毛穿刺和羊水穿刺的主要区别是穿刺的具体时间及穿刺的组织不同，绒毛穿刺最常见在11-14周完成，而羊水穿刺一般在孕18-23周进行，绒毛穿刺比羊水穿刺的伤害更大一些，更容易引起流产等情况。但是都是为了通过早期采取胎儿的组织进行基因及染色体的检测，能够早期诊断一些遗传病及染色体异常等疾病，便于早期治疗和及时地终止妊娠。
甲状腺细针穿刺使用直径小于5mm的特制针，超声动态监测下穿刺甲状腺内结节。
目的主要是区分结节的良性、恶性，是一个极其简单的操作过程。精细穿刺抽吸甲状腺结节部位，将抽吸的细胞液均匀涂抹在载玻片上，染色后显微镜下检查，细胞涂片可进行细胞学诊断报告，是判断甲状腺结节良恶性的金标准。该操作需要在超声全过程动态监测下进行，操作简便快捷，实现精确定位、精确穿刺。超声引导下细针穿刺已成为甲状腺术前病理学诊断的最常用方法。
唐氏筛查和羊水穿刺的区别如下:
唐筛属于筛查新生儿疾病的一种方法，主要是抽取孕妇的血液，通过血清学指标来判断胎儿是否存在疾病。而羊水穿刺主要用于检查胎儿染色体数目以及结构是否异常，常用于检查13-三体、18-三体、21-三体以及性染色体。做唐筛的时候需要空腹进行抽血，且要准确的提供末次月经、孕周或者体重等信息，避免检查结果存在误差。孕妇应当定期去医院进行产检，查看自身与胎儿的健康状态。
羊水穿刺过程不需要麻醉，因为注射麻醉药的疼痛可能会比羊水穿刺本身还要强烈。多数准妈妈在刚刚刺入时只会感觉轻微疼痛，类似于刺手指取血的痛感。脐带血穿刺及羊水穿刺染色体检查都可以检查胎儿脊柱有无畸形。脐带穿刺要根据胎盘的位置决定穿刺的部位，可以穿刺游离在羊水中的部分，或者穿刺脐带在胎儿侧的根部或在胎盘侧的根部。多数选择穿刺脐静脉。方法和羊水穿刺基本相同，只是穿刺部位不同而已。