慢性骨髓炎可以采用抗菌药物治疗，可以联合手术引流，或者病灶清除进行治疗，同时饮食上要注意多吃一些，蛋白质含量高的食物，纤维素含量，维生素含量高的食物。慢性骨髓炎是急性化脓性骨髓炎的延续，一般症状局限在局部，往往顽固难治。
针对各类型慢性骨髓炎来讲，单纯采用疗法，很难获得永久性治愈。服用中药丸剂或汤剂是从整体上将体内毒素―外邪排除。伤口不能过快愈合。否则，毒素在未排净的情况下滞留体内，短期内势必使皮肤再次溃破。而且细菌对中药几乎没有耐药性。总之治疗是让伤口由内向外愈合。这种愈合才是一种彻底的治愈。
慢性骨髓炎经常是由于急性期未能及时治疗，或有异物存在，或由感染引起。需要在骨科就诊。给予足量的抗生素进行抗菌治疗手术清除病灶，摘除死骨，清除增生的瘢痕和肉芽组织，消灭死腔，改善局部血液循环，为愈合创造条件。
慢性骨髓炎可以采取药物来抗感染，必要时需要手术进行治疗。在这段时间内要注意多休息，注意伤口的清洁，注意腿部的保暖，不要进行剧烈的运动。可以通过针灸或者是非甾体类的抗炎药物来改善慢性骨髓炎的病情。另外，还可以使用抗菌、抗生素类的药物，如果情况比较严重的话，可以通过外科切开引流来加快病情的恢复。术后要注意对患部位进行适当的护理。
采用手术、药物综合的疗法，即改善全身的症状，控制感染和手术处理相配合。对于重病长期卧床，尤其在血源性急性发作以后，急需改善全身状况，除了用抗菌药物控制感染以外，还要增进营养，必要时需要输血、手术引流及其他的治疗。