正常乳腺上皮细胞内存在ER、PR，当细胞发生癌变时，ER和PR出现部分和全部缺失。如果细胞仍保留ER、PR，则该乳腺癌细胞的生长和增殖仍受内分泌的调控，称为激素依赖性乳腺癌。如果ER或PR缺失，则该乳腺癌细胞的生长和增殖不再受内分泌的调控，称为非激素依赖性乳腺癌。HER2癌基因在正常乳腺组织中呈低表达，在乳腺癌组织中表达率可增高，其表达与乳腺癌的分级、淋巴结转移和临床分期呈正相关。
p53基因是一种抑癌基因，定位于人类染色体17p13.1，编码393个氨基酸组成的53kD的核内磷酸化蛋白，被称为p53蛋白。p53基因是细胞生长周期中的负调节因子，在肺癌，乳腺癌等检查是常见指标。P53有野生型和突变型之分。P53的表达与腋窝淋巴结转移呈正相关，P53的表达与临床预后不良呈正相关，P53的检测有利于判断乳腺癌的转移潜能。
乳腺癌免疫组化指标，通常看ER、PR、HER2。正常乳腺上皮细胞内存在ER、PR，当细胞发生癌变时，ER和PR出现部分和全部缺失。如果细胞仍保留ER、PR，则该乳腺癌细胞的生长和增殖仍受内分泌的调控，称为激素依赖性乳腺癌。如果ER或PR缺失，则该乳腺癌细胞的生长和增殖不再受内分泌的调控，称为非激素依赖性乳腺癌。
对于免疫组化的结果，首先是雌激素受体ER、孕激素受体PR。如果这两个都是阳性的提示，可能能够采用内分泌治疗的药物，也就是采用内分泌治疗有效。其次就是Her-2，人表皮生长因子受体-2，如果是阴性不能用靶向药物。再次如果是阳性，还需要进一步做FISH基因检测，若表达比较多也就是过度扩增才能够选择靶向药物治疗。
首先是雌激素受体ER、孕激素受体PR。如果这两个都是阳性的提示，可能能够采用内分泌治疗的药物，也就是采用内分泌治疗有效。其次就是Her-2，人表皮生长因子受体-2，如果是阴性不能用靶向药物，如果是阳性，还需要进一步做FISH基因检测。
乳腺癌免疫组化报告主要看四个指标，雌激素受体，孕激素受体，表皮生长因子受体，增殖细胞抗原。ER、PR阳性的病人适合内分泌治疗，HER2阳性的病人适合靶向药物治疗，Ki67的分界线为14，若超过则视为化疗指征。