肾脏平滑肌脂肪瘤的治疗应首先看肌瘤的大小和临床表现如何。如果肌瘤小于五公分，且无不适症状，可以不用治疗，不过每半年或一年要进行两次彩超检查，检查肌瘤的大小。如果肌瘤较大并引起疼痛，则需要手术治疗。
脂肪瘤属于良性肿瘤，可以是单个或多个，也可以发生在身体的不同部位。较小的脂肪瘤无明显症状，可伴有局部肿胀或压迫痛。不会变成恶性肿瘤。对于脂肪瘤，如果检测结果较大，可考虑切除。
肾脏血管平滑肌脂肪瘤，是一种良性肿瘤可以继续观察。如果有出血或者血管平滑肌脂肪瘤很大，可以考虑手术。手术的方式，要根据平滑肌脂肪瘤的位置、大小与周围的关系，决定采用什么样的治疗方案。如果肿瘤靠近肾脏的边缘，可以行血管平滑肌脂肪瘤剜除手术。如果血管平滑肌脂肪瘤长在肾实质，靠近肾门的地方，可能需要做肾部分切除。如果平滑肌脂肪瘤很大，占据肾脏的绝大部分，可以考虑根治性的肾切除手术。
脂肪瘤根据不同的部位可以有不同的治疗方式，像比较多见的就是有一些全身多发的脂肪瘤，可以发生在四肢和胸腹部，特点就是不会长很大，一般1到3cm，再一个就是不会癌变。这种脂肪瘤一般不需要特殊处理，只要观察就行。再一个就是身体其他部位，大部分都是脂肪瘤和脂肪肉瘤，长到一定程度需要手术。
较小脂肪瘤可以进行保守的观察。而对于较大的脂肪瘤或者是影响到美观的脂肪瘤，可以通过手术或通过抽脂的手术来进行治疗。脂肪瘤本身通常难以自行消除，一般建议进行手术治疗。
脂肪瘤的治疗以手术治疗为主，脂肪瘤为起源于脂肪组织的良性肿瘤，如果单发的生长在体表部位，没有任何临床症状的可以观察，等待而不需要治疗，因为脂肪瘤几乎不会发生恶变，但有时候脂肪瘤生长得比较大而且长在面部、四肢等关键部位而影响到生活和美观，或者脂肪瘤长大后压迫到神经系统，引起明显的疼痛等可以采用手术切除来治疗。