在临床上只要不超过5厘米的囊肿都是可以通过中药将其调理，可以先服用一个月的相关药物，然后等月经干净后再次复查看看囊肿的变化，如果超过5厘米临床上治疗的可以方式是手术治疗，平时不要吃辛辣刺激的食物，多喝热水，多吃点清淡，避免剧烈运动以及挤压局部。
通常对于囊肿的治疗来说，首先要彻底分清区分囊肿是属于良性还是恶性的。如果囊肿是良性的，没有必要担心了，可以通过口服一些中药进行保守治疗慢慢调养。但如果囊肿是恶性的话建议要尽早采用手术的治疗方式进行治疗，如果手术治疗方式效果不佳的话，还可以再生全身化疗的方式，这些方法就可以彻底治疗囊肿。如肾脏囊肿，若是4cm以上的肾脏囊肿，可以通过腹腔镜手术就可以治疗；4cm以下的肾脏囊肿，也可以通过B超定位下穿刺进行治疗。
附睾囊肿需要手术，附睾囊肿由于局部炎症粘连使附睾管阻塞，其中微小单一的附睾输精管阻塞后管腔液潴留，形成囊肿，附睾囊肿会引起精子质量、精子活力和精子数量急剧下降，引发男性不育症，是会影响怀孕的。
宫颈腺囊肿是妇科常见病，一般不需要特殊治疗，但是应注意清洁、定期检查、注意护垫的使用，必要时可能需要物理治疗或手术治疗。
1.注意清洁：保持外阴清洁，避免不洁性行为，防止感染。
2.定期检查：定期进行妇科检查，如发现宫颈腺囊肿有增大或伴有其他症状，应及时治疗。
3.注意护垫的使用：避免长期使用护垫，因为护垫可能导致局部温度升高，有利于细菌繁殖，加重病情。
4.物理治疗或手术治疗：对于较大的宫颈腺囊肿，可以考虑物理治疗或手术治疗。
卵巢附件区的囊肿，如果是在5厘米以内可以暂时观察，可以在2次月经干净以后再重新复查。因为很多卵巢囊肿是功能性的，也就是有可能是卵泡囊肿或者黄体囊肿，一般2个月以后就会消失。如果观察2个月，囊肿继续增大或者没有消失，就是卵巢肿瘤，需要做手术。一定不要做剧烈活动，因为卵巢囊肿容易出现扭转。一旦出现扭转，必须要急诊做手术，会出现剧烈的腹痛，时间长了会引起卵巢的坏死，影响卵巢的功能。
