可以进行保守治疗。但是如果囊肿是比较大的，已经严重影响到了膝关节的相关运动，一定要进行手术治疗，以免耽误病情。右侧腘窝出现囊肿，首先要考虑囊肿的大小，如果囊肿是非常小，对于平时的运动是没有什么影响的。
腘窝囊肿跟过度劳累或局部肌腱肌肉等软组织炎症有关，中医方面用中医辨证论治，对证治疗，如用活血化瘀，健脾利湿，消肿止痛的方药，外用舒筋活血的药物外敷会有所好转。
要确定右腘囊肿的发生，首先应考虑囊肿的大小。如果囊肿很小，对正常运动没有影响，通常进行保守治疗。然而，如果囊肿相对较大，将严重影响膝关节的运动，需要进行手术治疗。
腘窝囊肿是需要通过手术来治疗的，这个是唯一的治疗方法了。可以到当地医院外科手术治疗的。手术后一般需要10天左右的时间恢复。平时注意休息，少进行站立，如果出现疼痛，可以进行热敷。
腘窝囊肿在绝大多数的情况下都需要手术治疗。因为只要发现腘窝囊肿，一般生长的都会比较大，不仅会引起小腿的血液供应，而且会导致下肢肿胀、疼痛，甚至有神经损伤症状，通常都需要在手术切开治疗。
如果左侧腘窝囊肿较小可以采取保守治疗，卧床休息，制动，尽量避免着凉或者劳累，劳损等不利因素，局部可以外敷活血化瘀的膏药或者配合针刺，艾灸等物理疗法，以促进囊肿吸收，如果左侧腘窝囊肿较大，可以选择手术治疗，切开后将囊肿摘除。