有些病变常规HE染色下缺乏特异性，从而给病理诊断造成一定的困难，这时就需运用免疫组化检查，将免疫学中抗体原体可以特异性结合的原理应用到组织切片上，从而成为诊断病理学中不可缺少的辅助性诊断工具，以确定某一病人患的是哪种恶性肿瘤。
首先要进行的是常规的体格检查，在临床中还要采用血液检查，即通过采血的方法获得机体的部分信息，如血常规、肝肾功能、血糖以及必要的肿瘤标志物、肿瘤循环细胞等一系列检查指标。
有许多类型的肿瘤，可以在良性肿瘤或恶性肿瘤中发现。需要根据肿瘤的类型和位置进行具体分析。如果出现乳房疼痛和肿块，需要进行乳房穿刺和活检。如果有乳腺癌，就需要手术切除。如果其他地方有癌变，就需要对症治疗。
恶性肿瘤的发病率逐年上升。常见的检查方法包括x光检查、ct检查、彩色多普勒超声检查、核磁共振检查、内窥镜和病理检查等。根据恶性肿瘤的部位和具体类型，根据免疫组化结果选择相应的治疗方案，如静脉化疗、局部放疗、中药治疗、免疫治疗和靶向治疗。
一般来说，患有卵巢囊肿要做肿瘤标志物检查，主要是因为卵巢囊肿大部分属于妇科良性肿瘤，但是还要排除有恶性程度的可能性，所以通常最好做肿瘤标志物的化验检查。此外，如果患者是卵巢囊肿，同时伴有痛经的症状，通过肿瘤标志物检查，如果检查发现CA125出现轻度升高，就高度怀疑是否由于子宫内膜异位症引起的囊肿，通常可为临床上下一步的治疗提供可靠依据。
肿瘤全项总共有二十多项，常见的有：癌胚抗原、甲胎蛋白、糖类抗原125、糖类抗原15、糖类抗原19-9的、非小细胞肺癌相关抗原、游离前列腺特异性抗原、总前列腺特异性抗原、神经元特异性烯醇化酶等。