局部治疗：直肠粘膜水肿者，可用生理盐水、0.5-1％鞣酸、1：5000溶液灌洗直肠。粘膜糜烂者，可涂以％醋酸可的松溶液或10％硝酸银溶液。括约肌、肛提肌痉挛者，可将温橄榄油注入直肠内。直肠粘膜萎缩变干者，可每晚于直肠内注入0.5％油适量。临床上，用蜂蜜、芝麻油各50-100毫升和黄霉液50-100毫升，隔一天交替保留灌肠，每天2次，有很好的疗效。
因直肠距肛门较近，若经肠镜确诊为直肠炎，症状轻时，可使用药物治疗。如伴有溃疡性结肠炎，则要针对性治疗。若为放射性直肠炎，可加用保护剂，效果较好。若直肠炎症状较重，出现便血等症状，可辅助使用抗生素消炎治疗，甚至加用止血类药物。
选择正规医院接受治疗就可以了。去做一个肠镜，看一下肠道内壁情况。单纯的肠炎，首先要控制饮食，避免辛辣刺激冷硬食物，规律进餐，然后消炎治疗，可以考虑用抗生素灌肠。大便习惯和大便性状改变的，建议化验大便常规以及大便潜血，必要时还要做结肠镜检查，除外器质性疾病，还是功能性疾病，明确诊断后指定治疗方案。
直肠炎的治疗方法包括：1.一般治疗：适当休息，进清淡、少渣、营养丰富、无刺激性的食物，并做到心情愉快，劳逸结合；2.药物治疗：修复肠黏膜，缓解出血症状；3.穴位埋线：可长期刺激穴位，促进血液循环，加快炎症吸收，加速溃疡愈合。
直肠炎的治疗时间根据病症、严重程度、个人体质来说都是不同的，所以没有确定的能康复的时间。个人个体差异较大，生活方式不同，治疗方案不同，每个人对治疗的反应也不同，时间也不同。平时注意清淡饮食注意作息，会加快康复时间。