肛周脓肿的中医辩证治疗分为内治法和外治法两种，想要治疗肛周脓肿就要从脓肿处着手，中医在治疗肛周脓肿上有独特的方法，就是在肛周脓肿形成后就可以进行一次性治好手术治疗，手术后采用中药熏洗，坐浴，伤口局部清洁换药，局部理疗等治疗方法，效果很不错。
肛周囊肿便前便后坐浴熏蒸，平时要注意局部的卫生，每天早上起来的时候喝一杯温盐水或凉白开水，这样可以使食物更快地消化掉。不要长时间坐着，多做一些运动。每天都要大便，但是时间要短。勤换内裤。
肛瘘的治疗原则是将瘘管切开，形成敞开的创面，促使愈合。肛瘘不能自愈，不治疗会反复发作，需要手术治疗。肛瘘的手术方式很多，手术是减少肛门括约肌的损伤，防止肛门失禁，同时避免肛瘘的复发。
肛周囊肿早期服用清热解毒的中药治疗有一定的效果。肛周脓肿是肛门周围软组织间隙的一种化脓性感染，处理不当容易形成肛瘘。拔罐疗法，即在肛门周围肿突出部位技罐10-20次，日3-4次，十五次一疗程。有效率是90%，也可以中药治疗，但需要辩证。
中医治疗不好，还是需要西医治疗。发生肛中脓肿，需要做切开引流的，因为脓肿属于局部的感染，单纯的中医保守治疗没有什么效果，只会耽误疾病的发展。越早期手术治疗越好。