肛周囊肿可以手术治疗，抽脓减压局部消毒，用20ml注射器从脓肿最薄弱处刺入脓腔，抽取脓液，边抽边上下移动针头，直至无脓可抽。本方法可以暂时减轻脓腔张力，缓解疼痛，适用于临时应急处理。
肛周脓肿中医治疗效果较慢，效果因人而异，此病是常见的肛门的感染的疾病，主要是在肛门周围的感染，导致形成局部疼痛，红肿，局部皮肤发热的现象。如果形成脓肿，会有波动感，这样需要手术治疗引流脓液，进行抗炎治疗。平时避免吃辛辣的食物，避免喝酒，保持大便通畅。
肛周脓肿是由于肛管直肠周围软组织或周围间隙内发生急性化脓性感染所致。建议出现肛管直肠周围脓肿应及时治疗，少数肛周表浅的脓肿可采用抗生素治疗、热水坐浴、局部理疗等方法消散，但多数需要手术切开脓肿，充分引流脓液，防止其不断扩散，以减轻疼痛等症状。
肛周囊肿最多见的就是皮脂腺囊肿，或者是浅表的感染之后继发的囊肿，会有明显的肿物，或者病人出现排便异常，甚至排便不成形，排便困难；反复的刺激也会导致大便带血，进而影响到病人的生活或者工作。
越早手术越好，因为这与医生的技术和经验有很大关系，所以建议一定要到正规的肛肠专科医院手术治疗，建议注意饮食规律，不过饱过饥，不食用生冷寒凉的食物，生活中可以多增加姜枣，扁豆等具有健脾功效的食物。