肛窦炎可以用一些消炎抗菌的药物治疗。如果药物治疗效果不好，也可以通过手术治疗。肛窦炎是指肛门直肠区域发生的炎症。性病变可能导致肛门周围发红、肿胀和瘙痒等症状。必要时，应该去医院检查并听从医嘱。在平时生活当中，应小心清洁下体。
出现了肛窦炎如果是比较轻点的就可以选择药物，主要抗生素类药物消除炎症药物，如果是较严重的肛窦炎就要选择手术治疗了。肛窦由于其特殊的解剖结构容易出现炎症问题，基本上细菌的比较多，严重的可导致肛周脓肿的出现。
肛窦炎也可以部分用一些痔疮软膏来治疗，起到一定的作用。当然，药物治疗前可以使用蒲公英坐浴进行辅助治疗，更多的是需要注意饮食，辛辣刺激的食物是不能吃的，多喝水，多吃新鲜蔬菜、水果和粗纤维食物，并有规律地生活，只有这样才能定期避免便秘。
肛窦炎的病人可以肛门指诊检查、肛门镜检查等检查的结果进行相应额打确诊。如果病人是症状轻微的是可以采取药物治疗、坐浴的方式进行保守治疗。在病情恶化时，病人可以采取切除术、切开术等手术治疗。
治好肛窦炎可以温盐水坐浴局部，使局部保持清洁，同时可口服抗生素，肛窦炎经药物治疗无效，或肛窦内已成脓肿，或并有肛乳头肥大和隐性瘘管的病人，宜采用手术洽疗。
患有肛窦炎的病人可以用温盐水坐浴治疗，然后在肛窦底部使用5~银酸溶液，也可以用少量橄榄油灌肠。也可以使用各种类型软膏剂，同时口服抗生素。急需手术。肛窦炎如果不及时治疗，很容易引起肛瘘。