肛瘘的手术价格要根据肛瘘复杂程度，高位肛瘘还是低位肛瘘来确定，费用在4000元-20000万左右。
对于低肛瘘，如果患者选择门诊手术和局部麻醉，费用要低得多，如果是单纯的肛瘘，二级医院的手术费用约4000元，三级医院的手术费用约为8000元。如果是复杂的肛瘘，二级医院的费用在6000元以上，三级医院的费用在10000元以上。如果是高复杂性肛瘘，费用会更高，可能在2万元左右。包括术前相关检查费用、手术费用、床位费用、护理费用、换药费用等。
每个地方的收费都是不一样的，大概在5千元左右，肛瘘病人在手术初期，宜食少渣柔软易消化的食物，一方面术后消耗较大，卧床时间长，消化功能减退，应尽可能减轻消化道的负担；另一方面避免粗糙干硬的粪便对术后伤口的刺激，减轻疼痛。
肛瘘的治疗方法普通的有两种，挂线术和切除，挂线术就挺好，创伤小，恢复时间也快，费用没有一样的。术后最主要的就是保持切口部位的干净，不能吃辛辣刺激性食物，不能喝酒，大概彻底愈合在1个月左右，只有越干净，最后复发的几率就越小。
治肛瘘治疗费用大约在5000-1万元左右。肛瘘是临床肛肠科常见的一种疾病，大多是由肛周脓肿治疗不及时或不彻底逐渐迁延而来的，导致直肠出现瘘道不经肛门与外界相通，而出现漏粪汁的现象，发生炎症感染时都会出现疼痛，出血的症状。
肛瘘多久能痊愈；手术后按时换药，平时注意卫生，勤清洗，便后清洗，一般需要2-4周可以痊愈。建立正常的膳食习惯，因肛瘘的发生与湿热有关，对于油腻饮食，可以内生湿热，所以不宜多吃。养成良好的排便习惯，每日排便后坐浴保持肛门清洁，对预防感染有积极作用。避免一直保持同样姿势，坐着工作的人每隔一小时要能走动三、四分钟。
低位肛瘘在门诊即可解决，其综合费用在三千元左右；复杂肛瘘若需住院，费用在一万元左右；肛瘘一旦形成，手术是治疗高位肛瘘的方法；但手术中过度损伤肛直环会导致不可逆的肛门损伤及造成一系列的心理和经济负担，因此手术要充分保护肛门的核心结构“肛直环”；目前常用的手术方式主要分为括约肌保留术式和括约肌切断术式两大方向。