一般情况下，小孩做脑CT和核磁共振有一定伤害，但是伤害较小。
小孩做脑CT，通常有一定的辐射损小孩的全身影响是比较小的，因为一次脑CT受到的辐射量通常是有限的，只要不是多次进行，一般不会造成较大的伤害。而核磁共振对于孩子的伤害则相对更小，因为核磁共振的成像一般和射线没有较为明显的关系，因次，也不会对小孩造成较为明显的辐射性损伤。
从医学的角度来讲核磁共振是利用磁场原理成像，不是射线辐射原理，所以对孩子的几乎是没有任何伤害的，只是偶尔一两次是完全没有影响的，如果长期做核磁共振是对孩子有一定的影响。
儿童做脑部核磁是没有什么伤害的，因为影像学检查中有辐射的是头颅ct，X线。核磁只是利用磁场来进行检查的，跟射线是没有关系的，所以没有放射性危害。噪音大，这一点来说对孩子会造成一些不适。
小孩能做核磁共振。儿童如果在疾病的时候，要做到影像学的检查，是可以做磁共振的，因为磁共振是没有辐射的，但是因为磁共振做的时间比较长，需要小孩的配合，保持检查部位不动。
具体分析如下：
磁共振成像是利用核磁共振的原理，通过施加的梯度磁场来探测发射的电磁波的检查方式，可以绘制出结构图像。磁共振检查是没有辐射的，如果没有特殊情况，小孩儿、新生儿、儿童都可以放心通过磁共振的方式进行检查，所以一般，小孩儿做磁共振检查对身体没有任何损害。
如果小孩儿检查时烦躁不安，可以把软耳塞或棉球塞在外耳道。
小孩子做核磁共振对身体是没有任何伤害的。核磁共振的工作原理是磁场效应，而不是放射线。所以，对孩子身体没有任何伤害。如果孩子能配合，做核磁共振时不需要用任何药物。如果小孩子不能配合完成这项检查，要给予相应的镇静药物。