酵素的副作用和危害，主要有以下几点，过敏反应。少部分人进食后，会引起皮疹、瘙痒、出汗、腹痛等不良反应，因此对酵素过敏者应该禁用。目前市场上，很多酵素是自制的，没有标准配方，糖的含量超标，糖尿病病人应该慎用。
不会产生副作用，可以长期服用，有助于重病或疑难杂症的恢复。但是人体个别的差异性非常大，有些人对综合酵素也会过敏，只是反应程度与频率均很轻微。但这些症状并非由酵素副作用引起，简而言之，就是说酵素作为一种对身体很好的营养品，是没有任何副作用的。
通常情况下，孕妇可以喝酵素，但是不能多喝。
可以增强机体的免疫力，恢复弱碱体质，促进产后恢复，增加母乳质量等，可以多喝一些酵母菌，平时多吃些新鲜的蔬菜和水果，多做一些简单的体力活动，增强体质，保证充足的睡眠，避免熬夜，不能剧烈运动。怀孕期间，女性注意保暖，且一定要注意休息，避免多度劳累；注意适时的通风换气，保证空气清新流通。
一般情况下，小孩喝酵素要注意以下几方面：
1.酵素属于一种酶类，能够调节孩子的脾胃功能，改善胃肠道消化能力，适用于脾胃虚弱的孩子，如果小孩脾胃虚弱，可以在医生指导下适量喝酵素。
2.建议小孩子尽量在餐前半小时或者睡前一小时左右喝酵素比较好，因为这两个时间段孩子处于空腹状态下，有利于身体较好的吸收与消化。
3.给孩子喝酵素时不宜用热水稀释，热水稀释可能会破坏酶的作用。
酵素实际上是一种可以加速身体脂肪消耗的酶。酒精是一种高热量的饮品，酒精对人体脂肪的消耗会减少。至今还没有确切的证据表明酶对人体的健康具有明显的功效。
至于饮酒，为了身体的健康，还是不要饮酒为妙，因为饮酒过量，会对肝脏的损害很大，甚至会导致肝硬化。烟、酒，都会损伤肠胃和心脏，因此要合理膳食，合理膳食，多吃素，少吃盐，多咀嚼，多吃肉类。
夜间酵素副作用是过敏反应，少部分人进食后，会引起皮疹、瘙痒、出汗、腹痛等不良反应，因此对酵素过敏者应该禁用。糖尿病病人应该慎用。容易引起胃部不舒适的感觉，酵素属于弱酸性的物质。