可能会出现皮肤过敏反应，表现为皮肤瘙痒，皮疹，皮肤发红等症状。长期使用会对肝肾功能有影响。如果用于退烧，必须在38.5摄氏度，或者38.5摄氏度以上才能使用，每天不能超过4次使用。
小儿退热栓副作用是偶见皮疹、荨麻疹、药热及粒细胞减少；长期大量用药会导致肝肾功能异常。小儿退热栓为乳白色或微黄色栓剂，用于普通感冒或流行性感冒引起的发热，头痛。
这两个副作用都比较小，小儿退热栓主要成分是对乙酰氨基酚，布洛芬的成分就是布洛芬。副作用相对都小，都可用。同时多给宝宝喝水，这两种的退热效果都是一样的，需要看孩子喜欢哪种方式。退热栓应用方便一些，布洛芬的口感稍微差一些，在退烧方面的作用都是一样的，一般需要半小时到一个半小时，体温正常。温水擦拭手心、脚心、额头、腋窝、腹股沟等地方，多喝水，勤监测体温。
小儿柴桂退热颗粒一般没有明显的副作用，大部分孩子都是可以接受的，但是有的孩子吃了之后，有可能会出现大便偏稀等胃肠道的症状，如果症状比较明显，需要及时的停药。
退热栓对宝宝的危害主要增加了肝脏和肾脏的排泄负担。退热栓的主要作用是退热，因为是外用，所以副作用相对于口服退烧药比较小。但是这款药如果超量使用是会引起体温过低和恶心、呕吐。退热栓肝功能不全的宝宝要慎用。