胆囊结石且胆囊萎缩应该手术治疗，因为胆囊结石的癌变率大概10%，当胆囊出现萎缩的时候，说明胆囊的功能就不健全了。这时候胆囊既然没有功能，里面又有大量的结石，这样引起癌变几率比较大。
萎缩性胆囊结石，治疗上可以采用些消炎利胆及保肝护肝类药物治疗。平常以清淡饮食为主，戒烟酒。不吃辛辣刺激油腻的食物。该病一般是因为患有胆囊结石时间比较长了，而且胆囊结石容易诱发胆囊炎，长期患有胆囊炎就容易导致胆囊萎缩。
胆囊结石可能是以下原因引起的。
胆囊结石是由多种原因造成的，不管是什么原因造成的，都会导致胆汁的酸性、胆固醇的代谢紊乱，从而导致胆汁在胆囊内沉积，从而导致胆囊内的结石。肥胖、长期暴饮暴食、高脂肪、高蛋白饮食、高脂血症、糖尿病、胃肠道手术、肝硬化等都属于高风险的危险因子。另外，一些年轻人因为不喜欢吃早饭，导致胆囊中的胆汁滞留太久，导致了胆囊结石的发生。
产妇胆囊结石通常可以使用药物来治疗，在产后行手术。
如果怀孕时有胆囊结石，通常不能做胆囊切除手术，因为胆囊切除术是要做全身麻醉的手术，这样会对怀孕产生一定的影响。建议在产妇在生产后再进行外科手术。如果怀孕期间因胆囊结石而出现胆囊炎，可应用抗生素或利胆的药物来控制感染，如感染持续时间过长，且已临近产期，则应在取出胎儿后进行胆囊切除，以控制病情发展。
胆囊结石可以适量的吃洋葱的，胆结石患者的饮食上需要三餐定时饮食，不要进食过分油腻的食物，不要吸烟和饮酒，尽量少吃豆腐和菠菜以及动物内脏，不能饮酒以及暴饮暴食，需定期复查腹部彩超。