进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
肛瘘的检查方法可以做肛门指检，肛门指检为最常见、最直接的检查方法，可触及条索状物及硬结。还有就是美兰造影，将美兰从外口打进，如果美兰由肛门流出，可诊断肛瘘。影像学检查包括B超、磁共振、肛瘘造影。手术探查需在麻醉状态下进行。
可以做彩超检查，配合做尿常规检查，如果出现了急性膀胱炎，可能会出现尿急尿频。并且需要防止膀胱炎，导致出现上行性感染，反复发热比较容易出现肾炎的情况。平时多注意休息。
肛瘘的检查方法可以做肛门指检，肛门指检为最常见、最直接的检查方法，可触及条索状物及硬结。还有就是美兰造影，将美兰从外口打进，如果美兰由肛门流出，可诊断肛瘘。影像学检查包括B超、磁共振、肛瘘造影。手术探查需在麻醉状态下进行。
精液检查的要求是在检查的4到7天内禁止性生活，精液检查一般是通过自慰或者按摩而射精，所以在检查之前需要把手及阴茎和会阴部位进行清洗干净，晨起采精要比其他时间好一些。精液检查可以作为夫妻双方的备孕检查，一些有不孕史的男性可以通过精液检查，来看精子的活力是否足够、精子是否有畸形的情况，看看是不是患有无精症等，针对不同情况可以先给予一定的治疗，另外对精囊炎、睾丸萎缩等疾病也有很好的判断。
检查卵巢该做性激素六项检查、超声检查等。
卵巢有器质性和功能性两种类型。卵巢有没有囊肿和肿瘤，需要通过超声波来判断卵巢的形态和有没有长物。要想了解卵巢的机能，了解体内的荷尔蒙水平，需要进行血液检测，以了解性荷尔蒙六项目，以及卵巢的机能。卵巢是分泌激素、分泌卵泡、分泌卵泡的组织，需要通过血液检查，检查雌激素、孕激素、雄激素等激素的含量，来判断卵巢的机能。
