注射亮丙瑞林的副作用有内分泌系统，发热，颜面潮红，发汗，性欲减退，阳痿，男子女性化乳房，睾丸萎缩，会阴不适等现象，肌肉骨骼系统，可见骨疼痛，肩腰四肢疼痛，泌尿系统，可见排尿障碍，血尿尿血，循环系统，可见心电图异常，心胸比例增大等，消化系统，恶心，呕吐食欲不振等，此外，过敏反应，可见皮疹瘙痒痒疹。
通常来说，注射醋酸亮丙瑞林后1~3个月左右来月经。
醋酸亮丙瑞林主要适用于子宫内膜异位症，以及伴有月经过多、下腹痛、腰痛及贫血等临床症状的子宫肌瘤，可使肌瘤缩小、症状改善，或者绝经前乳腺癌、前列腺癌、中枢性性早熟症等疾病，而女性患者在注射醋酸亮丙瑞林后，通常情况下，需要在1~3个月左右才会有月经恢复。
抗瘤肿瘤药物，用于子宫内膜异位症或前列腺癌等，对伴有月经过多、下腹疼痛、腰痛及贫血等的子宫肌瘤，可使肌瘤缩小、闭经前乳腺癌，且雌激素受体阳性患者、中枢性性早熟症。用药有副作用的，可见皮疼瘙痒等。注射局部疼痛，硬结，发红。可见浮肿，胸部压迫感，发冷，疲倦，体重增加，听力衰退，耳鸣，头部多毛，尿酸等，要注意休息，多补水，注意加强饮食营养，不要喝酒。
亮丙瑞林没有失眠的副作用，相关副作用如下：
1.间质性肺炎表现：部分患者可能伴有发热、咳嗽和呼吸困难。间质性肺炎的表现可在胸部X线检查中发现。
2.过敏：少数患者在使用亮丙瑞林后出现不同程度的过敏症状，如全身皮疹或瘙痒。
3.转氨酶升高：一些患者在使用亮丙瑞林后可能出现转氨酶升高甚至黄疸。
4.血糖异常：轻度prop患者可能出现血糖异常或糖尿病症状加重。
5.血栓形成：部分患者治疗后可能会出现不同部位血栓形成，导致心肌梗死和脑梗死。
亮丙瑞林的副作用有可能会出现潮热，出汗，失眠，烦躁，性欲减退的，骨关节疼痛等。亮丙瑞林局部注射部位可能出现发红，疼痛，硬结等。还可见过敏反应，如皮肤瘙痒等。注射亮丙瑞林之后，有一部分会出现恶心、呕吐，食欲不振的表现。
通常情况下，如果是巧克力囊肿术后患者，为了防止其复发，术后要进行肌注乙酸亮丙瑞林。在肌注醋酸亮丙瑞林时，一般不会怀孕，因为肌注药物可以抑制卵巢的内分泌和排卵功能，可以抑制卵巢分泌雌孕激素，同时还可以抑制卵巢排卵。
因此在这段时间内，女性是不可能怀孕的。正常情况下，停药后一个月内可以恢复排卵，从而导致妊娠。