饮食上要注意避免辛辣刺激食物，及油炸食物。避免烟酒，注意多摄入新鲜水果蔬菜等富含维生素的食物。多摄入富含有纤维素的食物，比如各类粗粮，以保证大便的通畅排出。有一部分病人，肛瘘发生与身体的免疫功能异常有关系，这些病人容易对食物产生过敏，应该尽量避免虾、蟹、甚至牛奶等容易致敏的食物。
肛瘘病人要多吃润肠通便的果蔬，例如苹果、香蕉、梨等、冬瓜、香蕉、黑芝麻油，蜂蜜水等。为了促进肠蠕动还可喝酸奶，多食含膳食纤维丰富的食物，例如麦麸、豆类等。忌食有刺激性的食物，如酒类，辣椒，海鲜等。
肛瘘手术之后要建立一个正常的膳食习惯，肛瘘的发生与湿热有关，油腻性的饮食可以内生湿热，不宜多吃。应该多吃一些清淡、富含维生素的食物，比如绿豆、萝卜、冬瓜等新鲜的蔬菜瓜果。对于经久不愈的肛瘘多有虚证，饮食上多吃一些富含蛋白质的食物，比如瘦肉、牛肉、蘑菇等。
宜食用富含植物蛋白的食物；宜食用富含碳水化合物的食物；宜食用富含维生素，膳食纤维的食物。吃一些豆浆、土豆、冬瓜。忌口辛辣刺激油腻的食物；不喝刺激性饮料。容易上火的食物也不要吃。
可以吃些富含动物脂肪类食物如猪大肠，能够起到以肠补肠的作用，可以多吃些新鲜蔬菜水果如芹菜，韭菜，白菜，莲藕，冬瓜，丝瓜，萝卜，绿豆芽，香蕉，苹果，雪梨等都富含维生素，纤维素等营养物质，可以促进肠蠕动，保持大便通畅而调整胃肠功能，对改善肛瘘的症状有着很好的效果。
得了肛瘘应多食清淡并含有丰富维生素的食物，长治不愈的人应多吃含有丰富蛋白质类的食品。多吃蔬菜水果，如苹果、香蕉、梨等、冬瓜、丝瓜、绿豆、萝卜等加强肠蠕动，通利大便。