肛周脓肿是肛肠科的一种急重症，是肛瘘的初期阶段，长期不治或久治不愈很容易继发肛瘘，首先做局部的彩超，如果是单纯的炎块，可以输液治疗，看是否能控制住，或肿块消失。如果是有脓液形成，手术切开引流。
肛周脓肿的治疗包括外科治疗和放射治疗。术后应进行静脉抗感染治疗，以及术后间歇给药和创面换药。常见的抗炎药物包括菌素，因为菌素副作用相对较小，抗菌谱广，使用方便，适用于许多人。
初期肛周脓肿治疗去做肛门指诊检查，肛镜检查等。查找病因对症治疗。生活中注意调养，按时作息，少熬夜，多喝水，多吃新鲜的水果和蔬菜，忌食辛辣等刺激性食物，保持大便通畅。
肛周脓肿应及早就医。手术治疗是手术治疗的最主要的方法，主要采用抽脓减压、切开排脓的治疗方法，根据不同位置的肛周脓肿，采用不同的手术方式：低位脓肿－直接切开；马蹄脓肿－切开加旷置；高位脓肿－挂线术；高位脓肿-等压引流术。
传统的手术治疗比较麻烦，通常需要进行两次手术，第一部分是化脓清除，并在一段时间后当脓液破裂形成肛瘘，然后做肛瘘手术。如果它是一个相对简单的肛周脓肿，但对于更严重的脓肿腔破裂后形成的复杂肛瘘，很难准确地发现脓的来源，这不仅治疗并不完整，但也会带来巨大的痛苦。一般需要1-3个月的恢复时间。
是由于肛腺感染引起的肛周化脓性疾病，主要表现为肛周肿痛，下坠等不适。治疗方法可以一次性治好或先行脓肿切开手术，可以中医保守治疗。调理排便，养成良好的卫生习惯等对预防肛周脓肿有很好的效果。