一般情况下，引起慢性直肠炎的病因有很多，应在辩证的基础上，明确病因，根据病因，对症治疗。
口服药物有时候是中成药，有时候是中草药熬制成汤剂，中成药用的比较多的是肠炎宁，归脾丸，补充益气丸等。中草药一般是具有清热解毒，消肿散结，消炎止疼的功效，临床上比如黄连，黄芪，党参，蒲公英，五倍子等。也可以用以上中药煎汤灌肠治疗。取足三里、上巨虚、天枢穴、合谷穴等穴位。
中医讲究循序渐进医治病灶根本，将治疗直肠炎的中药煎煮后服用，过程需要一定的时间，如果服药外加按摩穴位效果就更好了，除了喝药跟按摩，病人平时生活中要多吃蔬菜、水果及富含粗纤维的食品，多饮水。
直肠炎是可以使用中药调理一段时间的，但由于发病的原因不同，所以使用的药物也是不同的，所以一定要遵医嘱吃药，而是一定要有一个良好的心态，不要吃一些不好消化的食物，吃东西的时候一定要细嚼慢咽。
中医认为本症是伤及正气，致肠粘膜破溃所引起，治则应以扶正固本，养血益气为主，兼以清热祛湿，以促进溃疡愈合，炎症消退，直肠炎病人的饮食原则、高热能、高蛋白质维生素无机盐要充足。
直肠炎平时注意腹部保暖，避免受凉。要饮食有规律，一日三餐做到定时定量，不过分饥饿、不暴饮暴食，这样有利于肠道消化平衡，避免因无节制饮食而，致肠道功能紊乱。治疗主要通过适当休息，进食清淡、营养丰富、刺激性少的食物，并得心情愉快，劳逸结合。