可以用敏感的抗生素来控制，或手术治疗。避免久坐湿地，以免肛门部受凉受湿，引起感染。保持肛门清洁，勤换内裤，便后清洁肛门，对预防感染有积极作用。应该忌吃鱼、虾、羊肉、香菜、韭菜等，竹笋、狗肉、海鲜等食物。
可以适用中药调理，中药副作用相对比较少，与术后炎症没有关联，中医诊断考虑为脾胃湿热引起的肛周脓肿。肛周囊肿的表现需要注意积极的使用手术进行切除为好的。尽量的注意不要最近有感染的现象出现，多吃些清淡食物。
肛周囊肿治疗主要采用手术方法。位于肛门口或者肛周皮下的囊肿，可以选择切开，并且要仔细地分离病变，避免残留。手术以后还需要抗感染治疗，在围手术期应该叮嘱病人流质饮食，避免形成干质的粪便，以免导致局部的污染。治疗是定期进行换药，注意局部卫生。
肛瘘的治疗原则是将瘘管切开，形成敞开的创面，促使愈合。肛瘘不能自愈，不治疗会反复发作，需要手术治疗。肛瘘的手术方式很多，手术是减少肛门括约肌的损伤，防止肛门失禁，同时避免肛瘘的复发。
肛周囊肿可以采取手术治疗，饮食上应以清淡并含有较多纤维素的食品为宜，如菠菜，芹菜，冬瓜，丝瓜，南瓜，绿豆，黄豆，油菜，黄花菜，海带，萝卜等。均有清热解毒的功效，能缓解肛肠肿痛，流脓流水等特征。