治肛门闭锁的费用大约是1万-3万元。先天性肛门闭锁是先天性肛门直肠畸形疾病之一，治疗费用会随着患者所处的地区和地区经济发展不同，医院收费标准不同，治疗费用也会有所差别的。
一般是可以治疗好的。通常都是采用手术治疗。方法有腹会阴肛门成形术，尾路肛门成形术，腹腔镜肛门成形术，骶会阴肛门成形，腹会阴肛门成形，或会阴肛门成形：在会阴中央或可激发环形收缩区的中间,做X形切口，长约1.5cm，切开皮肤，翻开4个皮瓣，其下方可见环形外括约肌纤维。
肛门闭锁检查费用一般是2百-4百元左右。因为医院的不同地区的不同，收费标准也不相同。由于肛门闭锁是先天直肠肛门发育不良造成的，出生后通过手术人造肛门。术后注意护理。
肛门闭锁的手术根据类型不同，可采取肠造瘘，会阴肛门成形，骶会阴肛门成形，腹会阴肛门成形等。如腹会阴肛门成形术：在会阴部、腹部做切口，将直肠游离，从盆腔至会阴做条隧道，将直肠穿出，与会阴皮肤吻合。
治疗肛门闭锁手术的费用是1万-3万元。手术的费用与孩子的自身情况有关，比如肛门闭锁的严重程度，位置都会影响价格。最好去正规医院的，这样比较放心，收费方面也比较合理的。