限制脂肪和膳食纤维：腹泻常伴有脂肪吸收不良，严重者伴有脂肪泻。因此膳食脂肪量要限制，应采用少油的食物和少油的烹调方法。对伴有脂肪泻者，可采用中链脂肪酸油脂。避免食用含刺激性和纤维高的食物。
局部治疗：直肠粘膜水肿者，可用生理盐水、0.5-1％鞣酸、1：5000溶液灌洗直肠。粘膜糜烂者，可涂以％醋酸可的松溶液或10％硝酸银溶液。括约肌、肛提肌痉挛者，可将温橄榄油注入直肠内。直肠粘膜萎缩变干者，可每晚于直肠内注入0.5％油适量。临床上，用蜂蜜、芝麻油各50-100毫升和黄霉液50-100毫升，隔一天交替保留灌肠，每天2次，有很好的疗效。
可以灌肠疗法结合口服消炎药，远离诱发因素，避免吃辛辣的食物。具体多长时间能够痊愈，在于病清的轻重了。平时要注意多多锻炼，多喝水，养成良好的生活习惯，不要熬夜，不要乱吃药。
直肠炎的治疗方法包括：1.一般治疗：适当休息，进清淡、少渣、营养丰富、无刺激性的食物，并做到心情愉快，劳逸结合；2.药物治疗：修复肠黏膜，缓解出血症状；3.穴位埋线：可长期刺激穴位，促进血液循环，加快炎症吸收，加速溃疡愈合。
因直肠距肛门较近，若经肠镜确诊为直肠炎，症状轻时，可使用药物治疗。如伴有溃疡性结肠炎，则要针对性治疗。若为放射性直肠炎，可加用保护剂，效果较好。若直肠炎症状较重，出现便血等症状，可辅助使用抗生素消炎治疗，甚至加用止血类药物。