这没有什么区别，看情况选择就行。如果是自己特别紧张，或者是没有明显的敏感的情况下，多数可以考虑对于普通的肠镜的检查，如果是太过于紧张的情况下，可以考虑无痛肠镜检查。
普通的肠镜和无痛的肠镜其实在手法及设备上都是差不多一样的。只是无痛肠镜在做之前需要全麻，全麻后不会有他痛苦的感觉，可以减少一些检查时的不适与风险。无痛肠镜的检查能降低应激反应，从而消除恐惧感和不适感，使内镜检查与治疗操作得以顺利进行，整个检查过程病患呈清醒状态，能进行语言交流和配合检查。
两者各有优缺点。应该看自身具体情况去选择。普通肠镜的话，一是价钱比较便宜，而且预约时间比较短，再就是操作过程中如果有不舒服的情况可以及时告知，减少肠穿孔的风险。缺点就是有些人不能耐受，会中途停止操作。无痛肠镜优点是检查痛苦比较少，完成度高，但是如果有心血管疾病基础的病人会存在麻醉的风险，如呼吸抑制、心律失常，还会增加肠穿孔的风险。
无痛胃镜肠镜有危险，具体分析如下：
首先，就是麻醉的风险，虽然是速效麻醉剂，但如果用药不当，很可能会出现精神错乱、烦躁、缺氧缺血性脑病、植物状态、死亡等。另外，与普通胃肠镜相比，因为缺乏沟通，所以在手术中，肠镜会出现充气过多、进镜速度过快，从而增加肠穿孔和系膜的过度牵扯。这就要求有熟练的麻醉师和内窥镜医生配合，才能进行无痛胃肠镜检查。
一般来说，无痛肠镜没有太大危险。
无痛肠镜没有太大危险，医疗操作规范的情况下风险系数相对较低。
无痛肠镜的风险在于，麻药的过敏反应，个别人会对麻药不耐受，出现呕吐现象，这种现象极少发生。患者在静脉麻醉情况下进行的肠道检查，由于患者处于睡眠过程中，因此完全无痛，患者舒适度高。建议去正规的医院去做，并且做手术之前应该放松心情，不要紧张。
无痛肠镜就是在普通肠镜的基础上，多了一个无痛麻醉监测费用和麻药的应用。普通肠镜全程操作的时候，是完全清醒的，消化内镜医师持肠镜，由肛门进入依次开始检查。因为结肠较长，可能会出现恶心、腹胀等不适感。