造成直肠炎的原因有慢性炎症的刺激：长期的慢性炎症可能是引起肛门直肠炎的要素。如慢性细菌感染、阿米巴痢疾、慢性非特异性结肠炎、憩室炎等，使得粘膜发生肉芽肿、炎性变和假息肉阶段而发生炎变。
长期的慢性炎症可能是引起肛门直肠炎的要素。如慢性细菌感染、慢性非特异性结肠炎等，使得粘膜发生肉芽肿、炎性变和假息肉阶段而发生炎变。此外，痔疮、肛瘘、肛裂、毛囊炎等长期刺激肛门皮肤，也可引起炎变。饮食不慎、过度饮酒、过食刺激性强的食物等，不适当的长期服用泻药，肛门内腐蚀性药物过多，细菌感染均可引起直肠炎。
性炎症的刺激：长期的慢性炎症可能是引起肛门直肠炎的要素。如慢性细菌感染、结肠炎、憩室炎等，使得粘膜发生肉芽肿、炎性变和假息肉阶段而发生炎变。良性肿瘤恶变：直肠腺瘤、乳头状瘤。
常有发作期与缓解期交替或持续性逐渐加重，偶呈急性暴发。直肠炎症状反复发作的原因有，轻信偏方、盲目治疗，许多人由于各种各样原因，不去正规肛肠医院进行治疗。轻信偏方，盲目服用药物，其结果只能是越治越重，治疗浅尝辄止，部分人虽然接受了正规治疗，但是却不能坚持下来，病情稍一缓解就擅自停止用药，结果造成病情反复发作，以至于越来越重，还导致疾病对药物的敏感性下降，耐药性增强，治疗难度加大。
最为常见的病因是直肠内异物损伤。未消化的骨片、木片或其他带有锐利角的各种异物可直接损伤直肠黏膜而发生直肠炎。此外，严重便秘时的坚硬粪块，可引起直肠炎甚或溃疡。重金属（汞、砷等）中毒或者发生以胃肠道损伤为主要特征的传染病时，常常并发直肠炎。