肛瘘脱肛主要症状流脓，周期性发作，时有时无，脓液较少。肿痛，一般不疼，当脓液积存于管腔内引流不畅时，局部胀痛，当脓液流出后疼痛马上减轻。肿块，可在肛缘触及索条状硬块，按压轻度疼痛。瘙痒，脓液经常刺激瘘口周围皮肤，致肛门皮肤瘙痒或湿疹。
肛瘘的原因与肛周脓肿、肛门直肠损伤、肛裂、反复感染、会阴手术等直接相关。临床表现主要为脓肿、肿胀和疼痛，一般无全身症状。如果有感染，有许多表现，如发烧等。肛瘘需要由附近医院的肛门直肠科进一步检查。明确的诊断可以在医生的指导下考虑。拉丝疗法、外科治疗等。
低位肛瘘常常只有一个外口，如果瘘管的位置表浅，可以在皮下摸到一条硬的索条，自外口通向肛管。高位的肛瘘位置较深，不容易摸到，外口有多个。有时脓液刺激的皮肤有瘙痒的感觉。如果外口暂时封闭、溶液积存局部呈红、肿并有胀痛。
低位肛瘘常常只有一个外口，如果瘘管的位置表浅，可以在皮下摸到一条硬的索条，自外口通向肛管。高位的肛瘘位置较深，不容易摸到，外口有多个。有时脓液刺激的皮肤有瘙痒的感觉。如果外口暂时封闭、溶液积存局部呈红、肿并有胀痛。
肛瘘临床表现为流脓、肿痛、瘙痒、排便困难、狭窄、贫血、身体消瘦、精神萎靡、神经衰弱等，流脓是主要症状，脓液多少与瘘管长短，多少有关，新生瘘管流脓较多，分泌物刺激皮肤而瘙痒不适，当外口阻塞或假性愈合，瘘管内脓液积存，局部肿胀疼痛，甚至发热。
低位肛瘘常常只有一个外口，如果瘘管的位置表浅，可以在皮下摸到一条硬的索条，自外口通向肛管。高位的肛瘘位置较深，不容易摸到，外口有多个。有时脓液刺激的皮肤有瘙痒的感觉。如果外口暂时封闭、溶液积存局部呈红、肿并有胀痛。