低位肛瘘一般选择手术治疗，治疗后的复发率在30%左右，肛瘘是比较常见的肛肠疾病，手术后要注意休息，注意个人卫生，不要久坐和久蹲，多做提肛运动，清淡饮食，多吃新鲜的蔬菜和水果，不要吃油腻辛辣刺激性的食物。
低位肛瘘情况可以引起肛门周围肿块经常溃破流出脓血，饮食清淡规律，忌辛辣刺激食物，注意休息不要长期久坐工作劳累，可以注意肛门清洁卫生，当地正规综合性医院肛肠外科肛检明确，进一步手术治疗肛瘘，术后一般复发率较低。
低位肛瘘指的是瘘管位置不穿过30%外括约肌的肛瘘，基本上是在肛周皮下的一些瘘管。除此之外，低位肛瘘还与肛门控便功能有关，很少引起肛门控便功能障碍的瘘管叫做低位肛瘘。
低位肛瘘与高位肛瘘症状是一样的，主要表现是肛门流脓、肿痛、肿块、瘙痒等症状，脓液经常刺激瘘口周围皮肤，致肛门皮肤瘙痒或湿疹。确诊是需要行肛门指诊或直肠镜检查，治疗是需要手术治疗的。
低位肛瘘不需要住院，属于小手术，不用过多担心。术后以抗炎治疗为主，要保持清洁卫生，饮食要以清淡为主，不可以吃辛辣刺激性食物，应该听从医生的安排。简单低位瘘的手术方法大同小异，即将瘘管内外口全部切开，使创面完全开放，然后经过换药使创面达到恢复。
高位肛瘘与低位肛瘘的区别在于，高位肛瘘是指瘘管已经到达坐骨直肠间隙、或者骨盆直肠间隙，低位肛瘘指瘘管的位置较浅，多在括约肌间隙、皮下脂肪间隙、或者是肛门后间隙。