肛窦炎和直肠炎是有区别的，肛窦炎较直肠炎的病变是相对局限的。先进行保守治疗为主，可以选用抗生素灌肠与口服全身用药同步进行。少纤维低脂肪食物有促进肠蠕动刺激肠壁的作用但不易消化对肠道不利故应限制。多油及脂肪类食物除不易消化外其滑肠作用又可使腹泻加重所以油炸烹调油煎及肥肉类和食用油应控制用量。注意补充蛋白质及维生素。
肛窦炎症状是排便时肛门疼痛，而且定位十分明确。肛门异物感、不适和肛管下坠感及肛门脓性分泌物。直肠炎症状是便血。直肠出血或直肠排出黏液、黏液血便。伴有全身症状或消化道其他部位疾病人可出现相关症状，如发热、食欲不振、恶心呕吐、消瘦、肛门灼痛、排便下坠、里急后重等。
肛窦和直肠位于不同的部位。肛窦炎是肛门的病变，直肠炎是直肠的病变，是肛门齿状线以上的炎症。直肠炎排便时会出现急性和严重的背脊症状。肛窦炎会有疼痛和少量出血。注意饮食，避免感冒，保持腹部温暖，注意休息和快速辛辣刺激的食物。
肛窦炎与直肠炎的症状不是完全一致的，肛窦位于肛门和直肠之间，肛窦炎和直肠炎的发生部位不一样，直肠炎的表现偏重于里急后重。疼痛腹泻、是两种疾病都具有的。肛窦炎会伴有少量出血，而直肠炎基本没有出血。
直肠炎症会引起每天排便的次数增加，肛隐窝蹭导致的炎症解大便的时候粪便压迫发炎的肛窦就会引起肛门灼痛会有少量，但是肛窦炎多数都是肛门疼痛，不会引起腹痛。做检查来确定直肠炎症抗炎治疗。
直肠炎和肛窦炎都是比较常见的肛肠疾病，大多数是不良的生活饮食习惯和久坐造成的，恢复较慢，治疗后容易复发。可以使用溶液或者是中药灌肠治疗，配合使用药物进行治疗，要清淡饮食，避免烟酒刺激。