国内的主要治疗方法都还是通过手术来治疗，很少有利用激光治疗的。而且肛瘘的主要病症是由于肛门处长有脓，因此，手术的主要原理是将其割破，从而使其流出来治疗。如果想要利用激光来做治疗肛瘘的手术，先要去专业的医院咨询医生，看是否可以，然后谨遵医嘱，细心治疗，配合医生的建议，自己在生活中也要多加注意。
肛瘘手术后可以用激光烤，肛瘘是一种非常常见的肛门病，肛瘘是由肛腺感染引起的，绝大部分肛瘘都是由肛周脓肿发展而来的。得了肛瘘，必须手术治疗。肛瘘术后，可以用相关药物进行坐浴，有助于肛瘘术后开放性创面的恢复。相关药物是一种强氧化剂，有去腐相关药物的作用。
肛瘘多久能痊愈；手术后按时换药，平时注意卫生，勤清洗，便后清洗，一般需要2-4周可以痊愈。建立正常的膳食习惯，因肛瘘的发生与湿热有关，对于油腻饮食，可以内生湿热，所以不宜多吃。养成良好的排便习惯，每日排便后坐浴保持肛门清洁，对预防感染有积极作用。避免一直保持同样姿势，坐着工作的人每隔一小时要能走动三、四分钟。
肛瘘多为化脓性感染所致，少数为特异性感染，如结核、克罗恩病、溃疡性结肠炎等感染亦可所致。最佳治疗办法可以手术处理。通常术后需要半月到一月时间恢复，手术观察期间一定要注意饮食生活作息，少吃辛辣刺激的食物，少喝酒，多注意局部的卫生清洗，勤换内裤。
肛瘘不能自己康复，肛瘘是肛周脓肿破溃以后形成的疾病，主要构成是内口，外口和瘘管，其中瘘管是一个坚硬的结缔组织管道，是不会自己康复的。只能通过手术将瘘管切除，内口敞开才能康复。
传统手术和微创手术。肛瘘的传统手术非常疼痛，特别是术后恢复时间超长，一般需要一个月左右的时间，因此病友间往往用“人间炼狱”来形容肛瘘的手术。因此，很多病者现在基本上不愿意接受传统手术，转而选择创口小、过程无痛、术后恢复快的微创手术进行治疗。