临床药理研究证实，苍耳子富含挥发油，芳香开窍，能改善鼻通气及嗅觉功能，并有抗菌，消炎，改善鼻粘膜血液循环，减轻血管渗透性等作用；黄芩对革兰氏阳性球菌和阴性球菌均有杀灭作用；苍耳子，对感冒病毒和鼻病毒等有抑制作用。
中药苍耳子具有通窍止痛、散风除湿等功效，可用于治疗外感病，鼻塞、鼻流浊涕等病症。另外，苍耳子还具有散湿止痛、关节疼痛、气血通畅、疏经络等作用，对风湿、类风湿等关节炎有一定的治疗作用。苍耳子还能降低血糖，对糖尿病有一定的辅助治疗作用。苍耳子能够抑制体表细菌，抑制真菌，改善皮肤病的症状，帮助恢复身体健康。
苍耳子主要用于风寒感冒，鼻渊，风湿痹痛，风疹瘙痒等证。苍耳子还有降低血压和血脂的功效，因此非常适合血压高的患者食用，把适量苍耳子放在砂锅中加入清水用大火浇沸口服，每天早饭前晚饭后各服用一次，就可以有效地降低血压和血脂。
苍耳子、薄荷、白芷、辛夷们组方以后合并玉屏风散，对肺脾气虚型的过敏性鼻炎可以起到很好的治疗作用，主要在通鼻窍、止鼻涕，可以起到益气固表，达到很有效的治疗方法，但是要注意苍耳子在治疗过敏性鼻炎也不能久用，因为苍耳子有小毒，尤其对孩子可以产生其他的副作用。
不能。苍耳子中含有一些有毒物质，这些物质会对神经以及肌肉造成影响。如果身体已经中毒，那么会表现出现恶心想吐、全身无力、头昏眼花还有肚子痛、呼吸困难、心情焦躁、手脚发凉等症状。如果问题比较严重，那么有可能出现黄疸、昏迷、体温下降，最后有可能导致混洗以及循环衰竭，甚至死亡。如果身体出现了由于血虚所导致的头痛还有疼痛情况，这类型患者不要将苍耳子泡水喝，避免病情加重。
苍耳子属于辛温解表药中的一种，有小毒，如果服用太多会引起中毒，可能会出现上腹部胀闷和恶心呕吐的症状，有时候还会出现腹泻和头痛烦躁的现象。鼻炎可以用苍耳子散或者鼻炎康治疗。苍耳子不适合长期大量用。