鳞状上皮细胞偏高，基本是由膀胱的病变和炎症引起的，正常来说鳞状上皮偏高，通常是在尿常规检查的时候出现的一种现象，主要考虑的是有膀胱粘膜的病变，或者是有妇科的慢性炎症的几率性比较大。进一步的检查，明确是否有细菌感染。
尿液当中上皮细胞偏高，首先考虑是慢性尿路感染引起的，或者是慢性的膀胱炎症引起，可以检查尿培养以及膀胱镜的检查，明确诊断，如果是存在致病微生物感染，需要持续的用抗生素。
正常的尿路被覆移行上皮细胞，仅靠近尿道口处覆盖有少量的鳞状上皮细胞。尿检时，尿液中出现鳞状上皮细胞增多，是在收集尿液标本时，男性没有上翻包皮，女性没有清洗外阴，使包皮垢或白带混入尿液所致。
可能和泌尿系结石有关，因为在排尿的过程中，由于尿液的冲洗，可能会导致结石损伤尿道。特别是输尿管结石，最可能引起的。这时患者需要到医院进行泌尿系彩超，可以明确诊断。
鳞状上皮细胞癌在进行检查的时候出现抗原升高，说明癌症复发，因为本身抗原属于一种肿瘤标志物，如果是进行血液检测的时候出现了明显的抗原升高，癌症复发并且达到中晚期的概率相对较高，仅仅通过抗原升高是无法确诊的，需要进一步进行病理学检查才能确诊。
正常人的尿液中会有少量的上皮细胞，如果是有炎症的时候，尿中的上皮细胞会增多，主要考虑尿路感染所导致。同时会有白细胞，还有细菌尿增高。有的时候，阴道或者其他的分泌物混入尿液中，也会表现尿中上皮细胞比较高，一般没有临床意义。