对于隐性脊柱裂的是不需要治疗的，因为隐性脊柱裂没有什么临床症状，也不会表现出异常的情况下，只需要定期的复查和随访，并且如果出现了某些大小便失禁、下肢麻木无力、会阴区感觉障碍，有可能在后期变为显性脊柱裂，则需要治疗。有的因为外伤或者是其他的某些病情变化，从而变成显性脊柱裂，则需要通过积极的方式进行治疗。
隐性脊柱裂需要考虑手术治疗的。还需要配合营养神经药物治疗帮助神经恢复的。隐性脊柱裂是一种常见于腰骶部椎体，出现一个或数个椎体的椎板没有完全闭合，但是并没有椎管内容物出现膨出。
隐性脊柱裂需要治疗，如果通过影像检查发现病人脊柱有裂隙，没有棘突缺失或椎管明显闭合不全，病人也没有外在症状表现，可以暂时采取保守治疗，观察病情变化，如果病人影像检查显示有脊髓栓系、脊柱纵裂等异常，同时伴有脊髓神经损伤后出现的肢体以及大小便功能异常，需要及时采取手术治疗。
隐性脊柱裂属于一种先天性的发育异常，是神经管发育畸形，是不能完全恢复的。如果没有脊髓栓系的症状，可以不用治疗。如果有脊髓栓系的症状，只能通过手术的方法进行治疗。要注意避免剧烈运动，尽量不要弯腰和久坐。
一般情况下，隐形脊柱裂导致尿床应该是局部有黏连，可导致脊髓受到牵拉出现脊髓功能缺失，出现尿床现象，患者应该尽早进行手术治疗。
对于持续尿床的病人来讲应尽快行脊柱核磁共振检查，明确脊柱裂部位，观察在局部有无粘连及脊髓脊膜膨出情况以及脊髓低端所处的位置，有无肿瘤等的生长，对于有脊髓栓系或肿瘤生长的患者要尽早进行手术治疗，将包块切除，并且行神经松解，椎管减压，并且将膨出的神经组织回纳入椎管内术后予以积极康复训练。
骶1隐性脊柱裂一般需要外科手术治疗。隐性脊柱裂是一种复杂的先天神经管发育畸形，常合并脊髓拴系综合征。一旦出现膀胱直肠和下肢功能障碍，往往被认为是不可恢复的，将需终生护理。只能外科手术干预治疗。显微外科的应用，使术中的解剖显露更为清晰，手术更为精细，使手术有可能造成的脊髓损伤降低到最低程度。
隐性脊柱裂患儿的神经在生长发育过程中受到进行性的机械性损伤，这种损伤来自于未完全闭合的神经管与皮下组织或骨性结构粘连导致的持续和因活动产生的间断牵拉作用。因此应尽早充分游离松解脊髓和神经，能够使由于脊髓缺血、变性等病理变化造成的神经功能障碍有逐渐恢复的可能。