骶管囊肿如果没有什么特殊症状以观察为主。如果骶管囊肿出现明显的症状，比如下肢和会阴部的感觉疼痛、麻木、大小便失禁，则需要相应的治疗措施。口服营养神经类药物和止疼类的药物对症处理。如果仍然没有明显疗效，则需要通过手术方式进行治疗。
通过脊柱的磁共振可以做出诊断，在治疗上主要以手术治疗为主，骶尾部的疼痛，会阴部的烧灼感，麻木，大小便障碍的则可以通过手术切除囊肿。没有临床症状的可以随访观察。
这种病变通过保守治疗方法很难整体去除掉，也就是说没有确切的保守治疗方法能让骶管囊肿消失。具体而言，保守治疗其实主要是针对病人出现一些比较轻微的症状，用一些对症的药物，比如止痛的药物或者其它的药物进行治疗。除此之外，没有其它更为有效的保守治疗方法，而通过这些药物治疗，也不太可能让骶管囊肿自行消失。
会出现阴部疼痛，腰部疼痛，坐骨神经疼痛的症状。对于NaborsIB型的骶管囊肿类型，大多数患者目前没有明显的症状。大约四分之一的NaborsII型瘘管囊肿患者有一定的症状，由于运动神经，交感神经纤维等都在瘘管内，会阴部疼痛，腰部疼痛，坐骨神经疼痛的症状，症状明显时，一定要采取专业治疗，以免造成延误造成的进一步损害。建议保证良好的生活和饮食习惯，适度参加户外运动，提高抗病能力和降低这种疾病发生的可能性。
骶管囊肿这个一般手术恢复需要时间在30天-45天左右，手术都是有一定风险的，可能损伤囊肿周围神经，这个大多术后恢复不错，注意术后护理，对于有症状者应在除外椎间盘突出、椎管狭窄或骶管内肿瘤的前提下，积极手术治疗，可以去当地医院检查治疗。
骶管囊肿不治疗不会死亡，骶管囊肿是囊肿性质的改变。是水球样的改变，一滩的脑脊液外面包裹一层水膜叫做骶管囊肿，不同于细胞的异常增生造成肿瘤性质的改变，都是良性的改变。