治疗男性的精子的畸形可以通过服用药物来调理治疗。平时生活中应该多吃富含锌硒的食物对改善精子畸形，及时补充蛋白锌硒有助于降低精子畸形率，增加精子数量，提高精子质量和免疫，提高男性生育能力。另外，要戒烟酒，忌食辛辣刺激性食物。
通常手术治疗是有效果的，导致精子畸形的原因常见于药物作用和精索静脉曲张，可以到医院检查治疗，在医生的指导下正规用药。简单的说畸形精子症就是发育不好的精子，正常男性的精液分析出，精子密度在每毫升两千万以上，A级精子就是直线运动的精子大于或等于25%，但是，头部正常形态的精子小于30%，就可以诊断为畸形精子症。
可以在医生的指导下，服用药物，具有一定的促精子发育的作用。如果效果不好，可以做精子的筛选。如果精子的畸形率过高，对怀孕的几率有一定的影响，即便是同房后怀孕，也容易出现胚胎发育不好情况的。
生活习惯不好、不洁性生活、长期服用药物、营养不良、经常高温蒸浴，会导致精子畸形率高。改善精子畸形需要明确病因，对症治疗。日常戒烟戒酒，无熬夜、无久坐。日常可以多吃黑豆、木耳类食物。
及早到正规医院详细的检查，明确病因后做针对性的治疗。精子畸形可造成男性不育症和妇女习惯性流产等。畸形精子如超过70%，应进行染色体检查，如有染色体病，则治疗困难。
精子畸形率高是不易怀孕，但是不能怀孕。精子的受精能力是和精子的正常形态结构密切相关，正常形态结构的精子数量越多，生育力就越强。精子形态异常的越多，受孕能力就越差。