肥厚性心肌病是一种遗传性疾病，大多数患者一般没有症状，不需要特殊的治疗。如果患者出现心率加快、呼吸困难、心前区疼痛等症状，可以服用美托洛尔片缓解症状，或者长期口服预防猝死；如果室间隔肥厚较重，部分肥厚室间隔可以通过手术切除进行治疗。一般需及时就医进行治疗，避免病情拖延，影响身体健康，平时做好日常护理工作，养成健康的生活习惯。
肥厚性梗阻性心肌病，又称为主动脉瓣下急性梗阻，主要是以心肌肥厚从而引起的心肌病，主要的特征有心室肌肥厚，从而造成心室容积减小，一般主要发生在左心室，也有的是发于右心室，在治疗方面可以选择药物进行治疗，但是需要坚持服药。
对于没有明显的临床表现，没有明显的临床表现是可以不必进行治疗的，这是由于病人的生命中没有明显的表现。若病人有临床表现，并有可能是因此病所致，可以服用美托洛尔，服用美托洛尔片；若病人的病情没有好转，可以转而使用维拉帕米。同时伴有心脏功能不全的病人也可以使用呋塞米片利尿；同时出现心律不齐的情况下，可以口服氨碘酮来提高心率。
一般情况下，梗阻型肥厚性心肌病可以进行药物治疗、手术治疗等。具体分析如下：
可以口服美托洛尔等药物，缓解左心室流出道阻塞，心衰、心律失常等药物，药物治疗无效，心功能不全，流出道阻塞时，可以采取外科治疗，缓解阻塞，这是当前最好的治疗方法，也可以考虑采用乙醇室间消融，但其远期疗效不明确，要谨慎。药物治疗不佳，也不能做外科治疗的，可以行起搏器治疗。
梗阻性肥厚型心肌病主要是药物治疗。
梗阻性肥厚性心肌病是肥厚性心肌病类型之一，表现在静息下左心室流出道和主动脉峰值压力阶差超过或等于30毫米汞柱的梗阻性。目前对该病的病因及发病机制尚未完全清楚。它的治疗指南建议应用β受体阻滞剂以减少血流，减轻流出道梗阻的压力。在临床工作中，β受体阻滞药常被用于高血压和心力衰竭等疾病。如果对β受体阻滞剂不能耐受或存在禁忌症者，可考虑服用维拉帕米等钙离子拮抗剂来改善症状。对无明显心律紊乱者，可选用非选择性血管紧张素转换酶抑制剂如卡维地洛。但对压力阶差的严重增大，或伴重度心衰，窦缓者慎用维拉帕米，亦可考虑手术治疗。对心功能不全患者来说，需要同时应用其他抗心力衰竭药物才能有效地控制心脏功能。
需要注意的是，具体用药应在专业医师的指导下进行。
肥厚性疾病的处理相对困难，以不一定能根治为主。
肥厚性心肌病以改善症状为主，降低并发症，防止猝死的发生，其中，药物治疗为肥厚性心脏病治疗提供了依据，以流出道梗阻为治疗目标的药物包括β受体拮抗剂，非二氢吡啶类钙通道阻滞剂等。当存在心衰时需针对心衰进行药物治疗，在伴有房颤的情况下，需给予抗凝治疗。对胸闷不舒服患者，应用硝酸酯类时，应引起重视，要排除外流道梗阻，以免用了以后加重病人的病症。非药物治疗以手术为主，酒精室间隔消融术为辅，及起搏治疗，对现在的病人普遍建议酒精室间隔消融，但还需结合适应症而定。